Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC47.97■■■■■ 5.27
CCDC180Q9P1Z9 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC47.97■■■■■ 5.27
CCDC180Q9P1Z9 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC47.97■■■■■ 5.27
CCDC180Q9P1Z9 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC47.97■■■■■ 5.27
CCDC180Q9P1Z9 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC47.96■■■■■ 5.27
CCDC180Q9P1Z9 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC47.96■■■■■ 5.27
CCDC180Q9P1Z9 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC47.96■■■■■ 5.27
CCDC180Q9P1Z9 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC47.96■■■■■ 5.27
CCDC180Q9P1Z9 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC47.96■■■■■ 5.27
CCDC180Q9P1Z9 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC47.96■■■■■ 5.27
CCDC180Q9P1Z9 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC47.96■■■■■ 5.27
CCDC180Q9P1Z9 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC47.95■■■■■ 5.27
CCDC180Q9P1Z9 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC47.95■■■■■ 5.27
CCDC180Q9P1Z9 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC47.94■■■■■ 5.26
CCDC180Q9P1Z9 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC47.94■■■■■ 5.26
CCDC180Q9P1Z9 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC47.94■■■■■ 5.26
CCDC180Q9P1Z9 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC47.94■■■■■ 5.26
CCDC180Q9P1Z9 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC47.93■■■■■ 5.26
CCDC180Q9P1Z9 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC47.93■■■■■ 5.26
CCDC180Q9P1Z9 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC47.93■■■■■ 5.26
CCDC180Q9P1Z9 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC47.92■■■■■ 5.26
CCDC180Q9P1Z9 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.92■■■■■ 5.26
CCDC180Q9P1Z9 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC47.92■■■■■ 5.26
CCDC180Q9P1Z9 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC47.92■■■■■ 5.26
CCDC180Q9P1Z9 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC47.92■■■■■ 5.26
CCDC180Q9P1Z9 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.91■■■■■ 5.26
CCDC180Q9P1Z9 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC47.91■■■■■ 5.26
CCDC180Q9P1Z9 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.91■■■■■ 5.26
CCDC180Q9P1Z9 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.9■■■■■ 5.26
CCDC180Q9P1Z9 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC47.9■■■■■ 5.26
CCDC180Q9P1Z9 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC47.9■■■■■ 5.26
CCDC180Q9P1Z9 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.9■■■■■ 5.26
CCDC180Q9P1Z9 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.89■■■■■ 5.26
CCDC180Q9P1Z9 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC47.89■■■■■ 5.26
CCDC180Q9P1Z9 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.89■■■■■ 5.26
CCDC180Q9P1Z9 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.89■■■■■ 5.26
CCDC180Q9P1Z9 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC47.89■■■■■ 5.26
CCDC180Q9P1Z9 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC47.89■■■■■ 5.26
CCDC180Q9P1Z9 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC47.88■■■■■ 5.26
CCDC180Q9P1Z9 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC47.88■■■■■ 5.25
CCDC180Q9P1Z9 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.88■■■■■ 5.25
CCDC180Q9P1Z9 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC47.88■■■■■ 5.25
CCDC180Q9P1Z9 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC47.87■■■■■ 5.25
CCDC180Q9P1Z9 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.87■■■■■ 5.25
CCDC180Q9P1Z9 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC47.86■■■■■ 5.25
CCDC180Q9P1Z9 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.86■■■■■ 5.25
CCDC180Q9P1Z9 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC47.86■■■■■ 5.25
CCDC180Q9P1Z9 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.86■■■■■ 5.25
CCDC180Q9P1Z9 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC47.85■■■■■ 5.25
CCDC180Q9P1Z9 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.85■■■■■ 5.25
CCDC180Q9P1Z9 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC47.85■■■■■ 5.25
CCDC180Q9P1Z9 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.85■■■■■ 5.25
CCDC180Q9P1Z9 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.85■■■■■ 5.25
CCDC180Q9P1Z9 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC47.85■■■■■ 5.25
CCDC180Q9P1Z9 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.85■■■■■ 5.25
CCDC180Q9P1Z9 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC47.85■■■■■ 5.25
CCDC180Q9P1Z9 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC47.85■■■■■ 5.25
CCDC180Q9P1Z9 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.84■■■■■ 5.25
CCDC180Q9P1Z9 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC47.84■■■■■ 5.25
CCDC180Q9P1Z9 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.84■■■■■ 5.25
CCDC180Q9P1Z9 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC47.83■■■■■ 5.25
CCDC180Q9P1Z9 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC47.83■■■■■ 5.25
CCDC180Q9P1Z9 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.83■■■■■ 5.25
CCDC180Q9P1Z9 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC47.83■■■■■ 5.25
CCDC180Q9P1Z9 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC47.82■■■■■ 5.25
CCDC180Q9P1Z9 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC47.82■■■■■ 5.25
CCDC180Q9P1Z9 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC47.82■■■■■ 5.25
CCDC180Q9P1Z9 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC47.82■■■■■ 5.25
CCDC180Q9P1Z9 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC47.82■■■■■ 5.25
CCDC180Q9P1Z9 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.82■■■■■ 5.24
CCDC180Q9P1Z9 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC47.81■■■■■ 5.24
CCDC180Q9P1Z9 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC47.81■■■■■ 5.24
CCDC180Q9P1Z9 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.81■■■■■ 5.24
CCDC180Q9P1Z9 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC47.81■■■■■ 5.24
CCDC180Q9P1Z9 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC47.8■■■■■ 5.24
CCDC180Q9P1Z9 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC47.8■■■■■ 5.24
CCDC180Q9P1Z9 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.8■■■■■ 5.24
CCDC180Q9P1Z9 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC47.8■■■■■ 5.24
CCDC180Q9P1Z9 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC47.79■■■■■ 5.24
CCDC180Q9P1Z9 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC47.79■■■■■ 5.24
CCDC180Q9P1Z9 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.79■■■■■ 5.24
CCDC180Q9P1Z9 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC47.79■■■■■ 5.24
CCDC180Q9P1Z9 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC47.79■■■■■ 5.24
CCDC180Q9P1Z9 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.79■■■■■ 5.24
CCDC180Q9P1Z9 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC47.79■■■■■ 5.24
CCDC180Q9P1Z9 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC47.78■■■■■ 5.24
CCDC180Q9P1Z9 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC47.78■■■■■ 5.24
CCDC180Q9P1Z9 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC47.78■■■■■ 5.24
CCDC180Q9P1Z9 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC47.78■■■■■ 5.24
CCDC180Q9P1Z9 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.78■■■■■ 5.24
CCDC180Q9P1Z9 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC47.77■■■■■ 5.24
CCDC180Q9P1Z9 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.77■■■■■ 5.24
CCDC180Q9P1Z9 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC47.77■■■■■ 5.24
CCDC180Q9P1Z9 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC47.76■■■■■ 5.24
CCDC180Q9P1Z9 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC47.76■■■■■ 5.24
CCDC180Q9P1Z9 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.76■■■■■ 5.24
CCDC180Q9P1Z9 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.76■■■■■ 5.24
CCDC180Q9P1Z9 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC47.75■■■■■ 5.24
CCDC180Q9P1Z9 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.75■■■■■ 5.23
CCDC180Q9P1Z9 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC47.75■■■■■ 5.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms