Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0U4

CXXC1, CXXC-type zinc finger protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXXC1Q9P0U4 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CXXC1Q9P0U4 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CXXC1Q9P0U4 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CXXC1Q9P0U4 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CXXC1Q9P0U4 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CXXC1Q9P0U4 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CXXC1Q9P0U4 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CXXC1Q9P0U4 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CXXC1Q9P0U4 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CXXC1Q9P0U4 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CXXC1Q9P0U4 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CXXC1Q9P0U4 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CXXC1Q9P0U4 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CXXC1Q9P0U4 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CXXC1Q9P0U4 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CXXC1Q9P0U4 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CXXC1Q9P0U4 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CXXC1Q9P0U4 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CXXC1Q9P0U4 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CXXC1Q9P0U4 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CXXC1Q9P0U4 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CXXC1Q9P0U4 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CXXC1Q9P0U4 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CXXC1Q9P0U4 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CXXC1Q9P0U4 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CXXC1Q9P0U4 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CXXC1Q9P0U4 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CXXC1Q9P0U4 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CXXC1Q9P0U4 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CXXC1Q9P0U4 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CXXC1Q9P0U4 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CXXC1Q9P0U4 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CXXC1Q9P0U4 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CXXC1Q9P0U4 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CXXC1Q9P0U4 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CXXC1Q9P0U4 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CXXC1Q9P0U4 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CXXC1Q9P0U4 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CXXC1Q9P0U4 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CXXC1Q9P0U4 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CXXC1Q9P0U4 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CXXC1Q9P0U4 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CXXC1Q9P0U4 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CXXC1Q9P0U4 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CXXC1Q9P0U4 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CXXC1Q9P0U4 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CXXC1Q9P0U4 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CXXC1Q9P0U4 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CXXC1Q9P0U4 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CXXC1Q9P0U4 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CXXC1Q9P0U4 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CXXC1Q9P0U4 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CXXC1Q9P0U4 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CXXC1Q9P0U4 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CXXC1Q9P0U4 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CXXC1Q9P0U4 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CXXC1Q9P0U4 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CXXC1Q9P0U4 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CXXC1Q9P0U4 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CXXC1Q9P0U4 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CXXC1Q9P0U4 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CXXC1Q9P0U4 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CXXC1Q9P0U4 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CXXC1Q9P0U4 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CXXC1Q9P0U4 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CXXC1Q9P0U4 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CXXC1Q9P0U4 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CXXC1Q9P0U4 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CXXC1Q9P0U4 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CXXC1Q9P0U4 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CXXC1Q9P0U4 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CXXC1Q9P0U4 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CXXC1Q9P0U4 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CXXC1Q9P0U4 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CXXC1Q9P0U4 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CXXC1Q9P0U4 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CXXC1Q9P0U4 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CXXC1Q9P0U4 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CXXC1Q9P0U4 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CXXC1Q9P0U4 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CXXC1Q9P0U4 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CXXC1Q9P0U4 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CXXC1Q9P0U4 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CXXC1Q9P0U4 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CXXC1Q9P0U4 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CXXC1Q9P0U4 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CXXC1Q9P0U4 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CXXC1Q9P0U4 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CXXC1Q9P0U4 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CXXC1Q9P0U4 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CXXC1Q9P0U4 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CXXC1Q9P0U4 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CXXC1Q9P0U4 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CXXC1Q9P0U4 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CXXC1Q9P0U4 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CXXC1Q9P0U4 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CXXC1Q9P0U4 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CXXC1Q9P0U4 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CXXC1Q9P0U4 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CXXC1Q9P0U4 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms