Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZV6

MSRB1, Methionine-R-sulfoxide reductase B1, humanhuman

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Length 116 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSRB1Q9NZV6 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MSRB1Q9NZV6 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MSRB1Q9NZV6 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
MSRB1Q9NZV6 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MSRB1Q9NZV6 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
MSRB1Q9NZV6 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MSRB1Q9NZV6 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
MSRB1Q9NZV6 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
MSRB1Q9NZV6 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MSRB1Q9NZV6 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MSRB1Q9NZV6 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
MSRB1Q9NZV6 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
MSRB1Q9NZV6 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
MSRB1Q9NZV6 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
MSRB1Q9NZV6 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MSRB1Q9NZV6 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
MSRB1Q9NZV6 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
MSRB1Q9NZV6 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MSRB1Q9NZV6 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MSRB1Q9NZV6 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
MSRB1Q9NZV6 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MSRB1Q9NZV6 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
MSRB1Q9NZV6 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MSRB1Q9NZV6 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MSRB1Q9NZV6 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MSRB1Q9NZV6 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MSRB1Q9NZV6 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MSRB1Q9NZV6 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MSRB1Q9NZV6 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MSRB1Q9NZV6 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MSRB1Q9NZV6 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MSRB1Q9NZV6 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MSRB1Q9NZV6 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MSRB1Q9NZV6 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MSRB1Q9NZV6 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MSRB1Q9NZV6 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MSRB1Q9NZV6 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MSRB1Q9NZV6 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MSRB1Q9NZV6 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MSRB1Q9NZV6 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MSRB1Q9NZV6 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
MSRB1Q9NZV6 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MSRB1Q9NZV6 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MSRB1Q9NZV6 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MSRB1Q9NZV6 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MSRB1Q9NZV6 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MSRB1Q9NZV6 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MSRB1Q9NZV6 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MSRB1Q9NZV6 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MSRB1Q9NZV6 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MSRB1Q9NZV6 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MSRB1Q9NZV6 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
MSRB1Q9NZV6 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MSRB1Q9NZV6 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MSRB1Q9NZV6 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MSRB1Q9NZV6 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MSRB1Q9NZV6 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MSRB1Q9NZV6 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
MSRB1Q9NZV6 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MSRB1Q9NZV6 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MSRB1Q9NZV6 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MSRB1Q9NZV6 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MSRB1Q9NZV6 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MSRB1Q9NZV6 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MSRB1Q9NZV6 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MSRB1Q9NZV6 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MSRB1Q9NZV6 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MSRB1Q9NZV6 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MSRB1Q9NZV6 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
MSRB1Q9NZV6 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MSRB1Q9NZV6 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MSRB1Q9NZV6 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MSRB1Q9NZV6 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MSRB1Q9NZV6 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MSRB1Q9NZV6 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MSRB1Q9NZV6 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MSRB1Q9NZV6 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MSRB1Q9NZV6 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MSRB1Q9NZV6 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MSRB1Q9NZV6 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
MSRB1Q9NZV6 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MSRB1Q9NZV6 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MSRB1Q9NZV6 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MSRB1Q9NZV6 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MSRB1Q9NZV6 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MSRB1Q9NZV6 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MSRB1Q9NZV6 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
MSRB1Q9NZV6 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MSRB1Q9NZV6 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
MSRB1Q9NZV6 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
MSRB1Q9NZV6 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
MSRB1Q9NZV6 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
MSRB1Q9NZV6 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
MSRB1Q9NZV6 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
MSRB1Q9NZV6 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
MSRB1Q9NZV6 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
MSRB1Q9NZV6 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
MSRB1Q9NZV6 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
MSRB1Q9NZV6 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
MSRB1Q9NZV6 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
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