Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG8

KCNK4, Potassium channel subfamily K member 4, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNK4Q9NYG8 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KCNK4Q9NYG8 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KCNK4Q9NYG8 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KCNK4Q9NYG8 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KCNK4Q9NYG8 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KCNK4Q9NYG8 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KCNK4Q9NYG8 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KCNK4Q9NYG8 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KCNK4Q9NYG8 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KCNK4Q9NYG8 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KCNK4Q9NYG8 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KCNK4Q9NYG8 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KCNK4Q9NYG8 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KCNK4Q9NYG8 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KCNK4Q9NYG8 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KCNK4Q9NYG8 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KCNK4Q9NYG8 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KCNK4Q9NYG8 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KCNK4Q9NYG8 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KCNK4Q9NYG8 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
KCNK4Q9NYG8 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KCNK4Q9NYG8 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KCNK4Q9NYG8 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KCNK4Q9NYG8 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KCNK4Q9NYG8 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KCNK4Q9NYG8 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KCNK4Q9NYG8 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KCNK4Q9NYG8 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KCNK4Q9NYG8 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
KCNK4Q9NYG8 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
KCNK4Q9NYG8 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
KCNK4Q9NYG8 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
KCNK4Q9NYG8 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KCNK4Q9NYG8 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
KCNK4Q9NYG8 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KCNK4Q9NYG8 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KCNK4Q9NYG8 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KCNK4Q9NYG8 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KCNK4Q9NYG8 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KCNK4Q9NYG8 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KCNK4Q9NYG8 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KCNK4Q9NYG8 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KCNK4Q9NYG8 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KCNK4Q9NYG8 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KCNK4Q9NYG8 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KCNK4Q9NYG8 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KCNK4Q9NYG8 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KCNK4Q9NYG8 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KCNK4Q9NYG8 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
KCNK4Q9NYG8 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KCNK4Q9NYG8 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KCNK4Q9NYG8 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KCNK4Q9NYG8 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KCNK4Q9NYG8 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KCNK4Q9NYG8 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KCNK4Q9NYG8 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KCNK4Q9NYG8 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KCNK4Q9NYG8 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KCNK4Q9NYG8 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KCNK4Q9NYG8 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
KCNK4Q9NYG8 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KCNK4Q9NYG8 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KCNK4Q9NYG8 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KCNK4Q9NYG8 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KCNK4Q9NYG8 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KCNK4Q9NYG8 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KCNK4Q9NYG8 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KCNK4Q9NYG8 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KCNK4Q9NYG8 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KCNK4Q9NYG8 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KCNK4Q9NYG8 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCNK4Q9NYG8 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
KCNK4Q9NYG8 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
KCNK4Q9NYG8 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCNK4Q9NYG8 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCNK4Q9NYG8 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KCNK4Q9NYG8 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KCNK4Q9NYG8 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KCNK4Q9NYG8 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KCNK4Q9NYG8 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KCNK4Q9NYG8 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
KCNK4Q9NYG8 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KCNK4Q9NYG8 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KCNK4Q9NYG8 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KCNK4Q9NYG8 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KCNK4Q9NYG8 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
KCNK4Q9NYG8 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
KCNK4Q9NYG8 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
KCNK4Q9NYG8 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KCNK4Q9NYG8 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KCNK4Q9NYG8 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KCNK4Q9NYG8 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KCNK4Q9NYG8 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KCNK4Q9NYG8 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KCNK4Q9NYG8 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KCNK4Q9NYG8 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KCNK4Q9NYG8 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KCNK4Q9NYG8 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KCNK4Q9NYG8 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KCNK4Q9NYG8 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms