Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYA4

MTMR4, Myotubularin-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR4Q9NYA4 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MTMR4Q9NYA4 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MTMR4Q9NYA4 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MTMR4Q9NYA4 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MTMR4Q9NYA4 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MTMR4Q9NYA4 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MTMR4Q9NYA4 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MTMR4Q9NYA4 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MTMR4Q9NYA4 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MTMR4Q9NYA4 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
MTMR4Q9NYA4 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MTMR4Q9NYA4 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MTMR4Q9NYA4 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
MTMR4Q9NYA4 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
MTMR4Q9NYA4 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MTMR4Q9NYA4 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MTMR4Q9NYA4 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MTMR4Q9NYA4 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MTMR4Q9NYA4 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MTMR4Q9NYA4 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
MTMR4Q9NYA4 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
MTMR4Q9NYA4 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
MTMR4Q9NYA4 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
MTMR4Q9NYA4 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MTMR4Q9NYA4 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MTMR4Q9NYA4 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
MTMR4Q9NYA4 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
MTMR4Q9NYA4 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MTMR4Q9NYA4 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
MTMR4Q9NYA4 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
MTMR4Q9NYA4 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
MTMR4Q9NYA4 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
MTMR4Q9NYA4 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
MTMR4Q9NYA4 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
MTMR4Q9NYA4 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
MTMR4Q9NYA4 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
MTMR4Q9NYA4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
MTMR4Q9NYA4 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
MTMR4Q9NYA4 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
MTMR4Q9NYA4 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
MTMR4Q9NYA4 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
MTMR4Q9NYA4 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
MTMR4Q9NYA4 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MTMR4Q9NYA4 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MTMR4Q9NYA4 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MTMR4Q9NYA4 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MTMR4Q9NYA4 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
MTMR4Q9NYA4 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
MTMR4Q9NYA4 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MTMR4Q9NYA4 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MTMR4Q9NYA4 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
MTMR4Q9NYA4 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
MTMR4Q9NYA4 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.93■■□□□ 1.9
MTMR4Q9NYA4 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
MTMR4Q9NYA4 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MTMR4Q9NYA4 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MTMR4Q9NYA4 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
MTMR4Q9NYA4 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
MTMR4Q9NYA4 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
MTMR4Q9NYA4 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
MTMR4Q9NYA4 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
MTMR4Q9NYA4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MTMR4Q9NYA4 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
MTMR4Q9NYA4 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
MTMR4Q9NYA4 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MTMR4Q9NYA4 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MTMR4Q9NYA4 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MTMR4Q9NYA4 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MTMR4Q9NYA4 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
MTMR4Q9NYA4 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MTMR4Q9NYA4 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MTMR4Q9NYA4 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
MTMR4Q9NYA4 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
MTMR4Q9NYA4 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
MTMR4Q9NYA4 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
MTMR4Q9NYA4 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
MTMR4Q9NYA4 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
MTMR4Q9NYA4 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
MTMR4Q9NYA4 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
MTMR4Q9NYA4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
MTMR4Q9NYA4 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MTMR4Q9NYA4 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MTMR4Q9NYA4 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MTMR4Q9NYA4 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MTMR4Q9NYA4 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MTMR4Q9NYA4 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MTMR4Q9NYA4 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MTMR4Q9NYA4 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MTMR4Q9NYA4 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MTMR4Q9NYA4 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MTMR4Q9NYA4 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
MTMR4Q9NYA4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MTMR4Q9NYA4 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MTMR4Q9NYA4 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MTMR4Q9NYA4 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MTMR4Q9NYA4 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MTMR4Q9NYA4 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MTMR4Q9NYA4 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MTMR4Q9NYA4 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MTMR4Q9NYA4 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms