Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXE8

CWC25, Pre-mRNA-splicing factor CWC25 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CWC25Q9NXE8 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CWC25Q9NXE8 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CWC25Q9NXE8 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CWC25Q9NXE8 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CWC25Q9NXE8 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CWC25Q9NXE8 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CWC25Q9NXE8 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CWC25Q9NXE8 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CWC25Q9NXE8 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CWC25Q9NXE8 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CWC25Q9NXE8 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CWC25Q9NXE8 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CWC25Q9NXE8 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CWC25Q9NXE8 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
CWC25Q9NXE8 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CWC25Q9NXE8 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CWC25Q9NXE8 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CWC25Q9NXE8 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CWC25Q9NXE8 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CWC25Q9NXE8 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CWC25Q9NXE8 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CWC25Q9NXE8 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CWC25Q9NXE8 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CWC25Q9NXE8 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
CWC25Q9NXE8 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CWC25Q9NXE8 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CWC25Q9NXE8 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CWC25Q9NXE8 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CWC25Q9NXE8 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CWC25Q9NXE8 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CWC25Q9NXE8 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CWC25Q9NXE8 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CWC25Q9NXE8 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CWC25Q9NXE8 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CWC25Q9NXE8 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CWC25Q9NXE8 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CWC25Q9NXE8 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CWC25Q9NXE8 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CWC25Q9NXE8 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CWC25Q9NXE8 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CWC25Q9NXE8 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CWC25Q9NXE8 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CWC25Q9NXE8 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CWC25Q9NXE8 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
CWC25Q9NXE8 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
CWC25Q9NXE8 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
CWC25Q9NXE8 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
CWC25Q9NXE8 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CWC25Q9NXE8 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CWC25Q9NXE8 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CWC25Q9NXE8 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CWC25Q9NXE8 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CWC25Q9NXE8 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CWC25Q9NXE8 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CWC25Q9NXE8 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CWC25Q9NXE8 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CWC25Q9NXE8 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
CWC25Q9NXE8 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CWC25Q9NXE8 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CWC25Q9NXE8 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CWC25Q9NXE8 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CWC25Q9NXE8 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CWC25Q9NXE8 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CWC25Q9NXE8 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CWC25Q9NXE8 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CWC25Q9NXE8 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CWC25Q9NXE8 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CWC25Q9NXE8 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CWC25Q9NXE8 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CWC25Q9NXE8 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CWC25Q9NXE8 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CWC25Q9NXE8 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CWC25Q9NXE8 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CWC25Q9NXE8 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CWC25Q9NXE8 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CWC25Q9NXE8 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CWC25Q9NXE8 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CWC25Q9NXE8 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CWC25Q9NXE8 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CWC25Q9NXE8 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CWC25Q9NXE8 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CWC25Q9NXE8 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CWC25Q9NXE8 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CWC25Q9NXE8 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CWC25Q9NXE8 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CWC25Q9NXE8 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CWC25Q9NXE8 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CWC25Q9NXE8 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CWC25Q9NXE8 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CWC25Q9NXE8 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
CWC25Q9NXE8 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CWC25Q9NXE8 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CWC25Q9NXE8 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CWC25Q9NXE8 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CWC25Q9NXE8 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CWC25Q9NXE8 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CWC25Q9NXE8 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CWC25Q9NXE8 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CWC25Q9NXE8 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CWC25Q9NXE8 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.5 ms