Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVS9

PNPO, Pyridoxine-5'-phosphate oxidase, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNPOQ9NVS9 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PNPOQ9NVS9 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PNPOQ9NVS9 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PNPOQ9NVS9 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PNPOQ9NVS9 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PNPOQ9NVS9 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PNPOQ9NVS9 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PNPOQ9NVS9 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PNPOQ9NVS9 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PNPOQ9NVS9 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PNPOQ9NVS9 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PNPOQ9NVS9 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PNPOQ9NVS9 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PNPOQ9NVS9 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PNPOQ9NVS9 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PNPOQ9NVS9 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PNPOQ9NVS9 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PNPOQ9NVS9 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PNPOQ9NVS9 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PNPOQ9NVS9 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PNPOQ9NVS9 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PNPOQ9NVS9 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PNPOQ9NVS9 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PNPOQ9NVS9 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PNPOQ9NVS9 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PNPOQ9NVS9 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PNPOQ9NVS9 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PNPOQ9NVS9 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PNPOQ9NVS9 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PNPOQ9NVS9 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PNPOQ9NVS9 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PNPOQ9NVS9 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PNPOQ9NVS9 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PNPOQ9NVS9 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PNPOQ9NVS9 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PNPOQ9NVS9 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PNPOQ9NVS9 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PNPOQ9NVS9 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PNPOQ9NVS9 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PNPOQ9NVS9 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PNPOQ9NVS9 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PNPOQ9NVS9 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PNPOQ9NVS9 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PNPOQ9NVS9 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PNPOQ9NVS9 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PNPOQ9NVS9 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PNPOQ9NVS9 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PNPOQ9NVS9 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PNPOQ9NVS9 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PNPOQ9NVS9 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PNPOQ9NVS9 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PNPOQ9NVS9 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PNPOQ9NVS9 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PNPOQ9NVS9 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PNPOQ9NVS9 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PNPOQ9NVS9 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PNPOQ9NVS9 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PNPOQ9NVS9 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PNPOQ9NVS9 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PNPOQ9NVS9 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PNPOQ9NVS9 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PNPOQ9NVS9 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PNPOQ9NVS9 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PNPOQ9NVS9 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PNPOQ9NVS9 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PNPOQ9NVS9 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PNPOQ9NVS9 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PNPOQ9NVS9 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PNPOQ9NVS9 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PNPOQ9NVS9 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PNPOQ9NVS9 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PNPOQ9NVS9 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PNPOQ9NVS9 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PNPOQ9NVS9 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PNPOQ9NVS9 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PNPOQ9NVS9 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PNPOQ9NVS9 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PNPOQ9NVS9 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PNPOQ9NVS9 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PNPOQ9NVS9 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PNPOQ9NVS9 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PNPOQ9NVS9 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PNPOQ9NVS9 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PNPOQ9NVS9 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PNPOQ9NVS9 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PNPOQ9NVS9 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PNPOQ9NVS9 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PNPOQ9NVS9 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PNPOQ9NVS9 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PNPOQ9NVS9 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PNPOQ9NVS9 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PNPOQ9NVS9 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PNPOQ9NVS9 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PNPOQ9NVS9 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PNPOQ9NVS9 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PNPOQ9NVS9 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PNPOQ9NVS9 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PNPOQ9NVS9 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PNPOQ9NVS9 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PNPOQ9NVS9 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms