Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUJ3

TCP11L1, T-complex protein 11-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCP11L1Q9NUJ3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TCP11L1Q9NUJ3 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TCP11L1Q9NUJ3 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TCP11L1Q9NUJ3 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TCP11L1Q9NUJ3 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TCP11L1Q9NUJ3 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TCP11L1Q9NUJ3 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TCP11L1Q9NUJ3 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TCP11L1Q9NUJ3 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TCP11L1Q9NUJ3 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TCP11L1Q9NUJ3 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TCP11L1Q9NUJ3 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TCP11L1Q9NUJ3 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TCP11L1Q9NUJ3 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TCP11L1Q9NUJ3 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TCP11L1Q9NUJ3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TCP11L1Q9NUJ3 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TCP11L1Q9NUJ3 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
TCP11L1Q9NUJ3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TCP11L1Q9NUJ3 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TCP11L1Q9NUJ3 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TCP11L1Q9NUJ3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
TCP11L1Q9NUJ3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TCP11L1Q9NUJ3 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TCP11L1Q9NUJ3 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
TCP11L1Q9NUJ3 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TCP11L1Q9NUJ3 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
TCP11L1Q9NUJ3 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC27■■□□□ 1.91
TCP11L1Q9NUJ3 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC27■■□□□ 1.91
TCP11L1Q9NUJ3 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TCP11L1Q9NUJ3 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TCP11L1Q9NUJ3 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TCP11L1Q9NUJ3 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TCP11L1Q9NUJ3 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TCP11L1Q9NUJ3 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TCP11L1Q9NUJ3 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TCP11L1Q9NUJ3 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TCP11L1Q9NUJ3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TCP11L1Q9NUJ3 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TCP11L1Q9NUJ3 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TCP11L1Q9NUJ3 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TCP11L1Q9NUJ3 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TCP11L1Q9NUJ3 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TCP11L1Q9NUJ3 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TCP11L1Q9NUJ3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TCP11L1Q9NUJ3 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TCP11L1Q9NUJ3 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TCP11L1Q9NUJ3 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TCP11L1Q9NUJ3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TCP11L1Q9NUJ3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TCP11L1Q9NUJ3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TCP11L1Q9NUJ3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TCP11L1Q9NUJ3 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TCP11L1Q9NUJ3 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TCP11L1Q9NUJ3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TCP11L1Q9NUJ3 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TCP11L1Q9NUJ3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TCP11L1Q9NUJ3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
TCP11L1Q9NUJ3 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
TCP11L1Q9NUJ3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
TCP11L1Q9NUJ3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TCP11L1Q9NUJ3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TCP11L1Q9NUJ3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TCP11L1Q9NUJ3 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TCP11L1Q9NUJ3 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TCP11L1Q9NUJ3 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TCP11L1Q9NUJ3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TCP11L1Q9NUJ3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TCP11L1Q9NUJ3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TCP11L1Q9NUJ3 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TCP11L1Q9NUJ3 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TCP11L1Q9NUJ3 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TCP11L1Q9NUJ3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TCP11L1Q9NUJ3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TCP11L1Q9NUJ3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TCP11L1Q9NUJ3 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TCP11L1Q9NUJ3 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
TCP11L1Q9NUJ3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TCP11L1Q9NUJ3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TCP11L1Q9NUJ3 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TCP11L1Q9NUJ3 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TCP11L1Q9NUJ3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TCP11L1Q9NUJ3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TCP11L1Q9NUJ3 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TCP11L1Q9NUJ3 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TCP11L1Q9NUJ3 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TCP11L1Q9NUJ3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
TCP11L1Q9NUJ3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TCP11L1Q9NUJ3 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TCP11L1Q9NUJ3 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TCP11L1Q9NUJ3 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TCP11L1Q9NUJ3 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TCP11L1Q9NUJ3 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
TCP11L1Q9NUJ3 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TCP11L1Q9NUJ3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TCP11L1Q9NUJ3 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TCP11L1Q9NUJ3 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TCP11L1Q9NUJ3 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TCP11L1Q9NUJ3 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TCP11L1Q9NUJ3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms