Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT22

EMILIN3, EMILIN-3, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMILIN3Q9NT22 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
EMILIN3Q9NT22 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
EMILIN3Q9NT22 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.89■■□□□ 1.9
EMILIN3Q9NT22 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
EMILIN3Q9NT22 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
EMILIN3Q9NT22 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
EMILIN3Q9NT22 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
EMILIN3Q9NT22 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
EMILIN3Q9NT22 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
EMILIN3Q9NT22 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
EMILIN3Q9NT22 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
EMILIN3Q9NT22 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
EMILIN3Q9NT22 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
EMILIN3Q9NT22 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
EMILIN3Q9NT22 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
EMILIN3Q9NT22 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
EMILIN3Q9NT22 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
EMILIN3Q9NT22 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
EMILIN3Q9NT22 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
EMILIN3Q9NT22 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
EMILIN3Q9NT22 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
EMILIN3Q9NT22 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
EMILIN3Q9NT22 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
EMILIN3Q9NT22 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
EMILIN3Q9NT22 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
EMILIN3Q9NT22 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
EMILIN3Q9NT22 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
EMILIN3Q9NT22 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
EMILIN3Q9NT22 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
EMILIN3Q9NT22 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
EMILIN3Q9NT22 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
EMILIN3Q9NT22 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
EMILIN3Q9NT22 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
EMILIN3Q9NT22 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
EMILIN3Q9NT22 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
EMILIN3Q9NT22 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
EMILIN3Q9NT22 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
EMILIN3Q9NT22 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
EMILIN3Q9NT22 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
EMILIN3Q9NT22 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
EMILIN3Q9NT22 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
EMILIN3Q9NT22 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
EMILIN3Q9NT22 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
EMILIN3Q9NT22 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
EMILIN3Q9NT22 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
EMILIN3Q9NT22 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
EMILIN3Q9NT22 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
EMILIN3Q9NT22 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
EMILIN3Q9NT22 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
EMILIN3Q9NT22 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
EMILIN3Q9NT22 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
EMILIN3Q9NT22 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
EMILIN3Q9NT22 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
EMILIN3Q9NT22 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
EMILIN3Q9NT22 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
EMILIN3Q9NT22 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
EMILIN3Q9NT22 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
EMILIN3Q9NT22 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
EMILIN3Q9NT22 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
EMILIN3Q9NT22 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
EMILIN3Q9NT22 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
EMILIN3Q9NT22 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
EMILIN3Q9NT22 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
EMILIN3Q9NT22 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
EMILIN3Q9NT22 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
EMILIN3Q9NT22 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
EMILIN3Q9NT22 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
EMILIN3Q9NT22 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
EMILIN3Q9NT22 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
EMILIN3Q9NT22 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
EMILIN3Q9NT22 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
EMILIN3Q9NT22 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
EMILIN3Q9NT22 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
EMILIN3Q9NT22 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
EMILIN3Q9NT22 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
EMILIN3Q9NT22 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
EMILIN3Q9NT22 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
EMILIN3Q9NT22 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
EMILIN3Q9NT22 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
EMILIN3Q9NT22 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
EMILIN3Q9NT22 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
EMILIN3Q9NT22 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
EMILIN3Q9NT22 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
EMILIN3Q9NT22 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
EMILIN3Q9NT22 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
EMILIN3Q9NT22 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
EMILIN3Q9NT22 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
EMILIN3Q9NT22 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
EMILIN3Q9NT22 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
EMILIN3Q9NT22 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
EMILIN3Q9NT22 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
EMILIN3Q9NT22 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
EMILIN3Q9NT22 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
EMILIN3Q9NT22 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
EMILIN3Q9NT22 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
EMILIN3Q9NT22 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
EMILIN3Q9NT22 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
EMILIN3Q9NT22 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
EMILIN3Q9NT22 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
EMILIN3Q9NT22 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms