Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC2

SALL1, Sal-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL1Q9NSC2 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SALL1Q9NSC2 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SALL1Q9NSC2 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SALL1Q9NSC2 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SALL1Q9NSC2 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SALL1Q9NSC2 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
SALL1Q9NSC2 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SALL1Q9NSC2 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SALL1Q9NSC2 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SALL1Q9NSC2 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SALL1Q9NSC2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SALL1Q9NSC2 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SALL1Q9NSC2 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SALL1Q9NSC2 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SALL1Q9NSC2 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SALL1Q9NSC2 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SALL1Q9NSC2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SALL1Q9NSC2 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SALL1Q9NSC2 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SALL1Q9NSC2 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SALL1Q9NSC2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SALL1Q9NSC2 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SALL1Q9NSC2 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SALL1Q9NSC2 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SALL1Q9NSC2 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SALL1Q9NSC2 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SALL1Q9NSC2 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SALL1Q9NSC2 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SALL1Q9NSC2 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SALL1Q9NSC2 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SALL1Q9NSC2 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SALL1Q9NSC2 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SALL1Q9NSC2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
SALL1Q9NSC2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SALL1Q9NSC2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SALL1Q9NSC2 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SALL1Q9NSC2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SALL1Q9NSC2 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SALL1Q9NSC2 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SALL1Q9NSC2 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SALL1Q9NSC2 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SALL1Q9NSC2 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
SALL1Q9NSC2 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SALL1Q9NSC2 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SALL1Q9NSC2 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SALL1Q9NSC2 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SALL1Q9NSC2 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
SALL1Q9NSC2 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SALL1Q9NSC2 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SALL1Q9NSC2 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SALL1Q9NSC2 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SALL1Q9NSC2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SALL1Q9NSC2 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SALL1Q9NSC2 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SALL1Q9NSC2 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
SALL1Q9NSC2 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SALL1Q9NSC2 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SALL1Q9NSC2 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SALL1Q9NSC2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SALL1Q9NSC2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SALL1Q9NSC2 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SALL1Q9NSC2 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SALL1Q9NSC2 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SALL1Q9NSC2 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SALL1Q9NSC2 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SALL1Q9NSC2 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SALL1Q9NSC2 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SALL1Q9NSC2 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SALL1Q9NSC2 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SALL1Q9NSC2 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SALL1Q9NSC2 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SALL1Q9NSC2 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SALL1Q9NSC2 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SALL1Q9NSC2 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SALL1Q9NSC2 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SALL1Q9NSC2 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SALL1Q9NSC2 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SALL1Q9NSC2 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SALL1Q9NSC2 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
SALL1Q9NSC2 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SALL1Q9NSC2 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SALL1Q9NSC2 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SALL1Q9NSC2 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SALL1Q9NSC2 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
SALL1Q9NSC2 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SALL1Q9NSC2 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SALL1Q9NSC2 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
SALL1Q9NSC2 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SALL1Q9NSC2 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SALL1Q9NSC2 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SALL1Q9NSC2 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SALL1Q9NSC2 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SALL1Q9NSC2 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SALL1Q9NSC2 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SALL1Q9NSC2 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
SALL1Q9NSC2 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SALL1Q9NSC2 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SALL1Q9NSC2 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SALL1Q9NSC2 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SALL1Q9NSC2 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms