Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB4

KRT82, Keratin, type II cuticular Hb2, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT82Q9NSB4 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT82Q9NSB4 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT82Q9NSB4 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT82Q9NSB4 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT82Q9NSB4 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT82Q9NSB4 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT82Q9NSB4 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT82Q9NSB4 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT82Q9NSB4 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT82Q9NSB4 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT82Q9NSB4 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT82Q9NSB4 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT82Q9NSB4 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT82Q9NSB4 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT82Q9NSB4 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT82Q9NSB4 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT82Q9NSB4 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT82Q9NSB4 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT82Q9NSB4 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT82Q9NSB4 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT82Q9NSB4 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT82Q9NSB4 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT82Q9NSB4 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT82Q9NSB4 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT82Q9NSB4 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT82Q9NSB4 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
KRT82Q9NSB4 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
KRT82Q9NSB4 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
KRT82Q9NSB4 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
KRT82Q9NSB4 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
KRT82Q9NSB4 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KRT82Q9NSB4 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KRT82Q9NSB4 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KRT82Q9NSB4 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KRT82Q9NSB4 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KRT82Q9NSB4 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KRT82Q9NSB4 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT82Q9NSB4 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT82Q9NSB4 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT82Q9NSB4 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT82Q9NSB4 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT82Q9NSB4 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT82Q9NSB4 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT82Q9NSB4 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT82Q9NSB4 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT82Q9NSB4 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT82Q9NSB4 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT82Q9NSB4 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT82Q9NSB4 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT82Q9NSB4 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT82Q9NSB4 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT82Q9NSB4 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT82Q9NSB4 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT82Q9NSB4 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT82Q9NSB4 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT82Q9NSB4 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT82Q9NSB4 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT82Q9NSB4 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT82Q9NSB4 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT82Q9NSB4 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT82Q9NSB4 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT82Q9NSB4 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT82Q9NSB4 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT82Q9NSB4 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT82Q9NSB4 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT82Q9NSB4 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT82Q9NSB4 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT82Q9NSB4 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT82Q9NSB4 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT82Q9NSB4 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT82Q9NSB4 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT82Q9NSB4 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT82Q9NSB4 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT82Q9NSB4 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT82Q9NSB4 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT82Q9NSB4 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT82Q9NSB4 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT82Q9NSB4 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT82Q9NSB4 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT82Q9NSB4 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT82Q9NSB4 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT82Q9NSB4 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT82Q9NSB4 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT82Q9NSB4 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT82Q9NSB4 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT82Q9NSB4 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT82Q9NSB4 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KRT82Q9NSB4 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KRT82Q9NSB4 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KRT82Q9NSB4 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KRT82Q9NSB4 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KRT82Q9NSB4 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KRT82Q9NSB4 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KRT82Q9NSB4 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KRT82Q9NSB4 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KRT82Q9NSB4 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KRT82Q9NSB4 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
KRT82Q9NSB4 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
KRT82Q9NSB4 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
KRT82Q9NSB4 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms