Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS71

GKN1, Gastrokine-1, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GKN1Q9NS71 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GKN1Q9NS71 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GKN1Q9NS71 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GKN1Q9NS71 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GKN1Q9NS71 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GKN1Q9NS71 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GKN1Q9NS71 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GKN1Q9NS71 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
GKN1Q9NS71 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GKN1Q9NS71 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GKN1Q9NS71 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GKN1Q9NS71 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GKN1Q9NS71 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GKN1Q9NS71 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GKN1Q9NS71 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GKN1Q9NS71 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GKN1Q9NS71 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GKN1Q9NS71 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
GKN1Q9NS71 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GKN1Q9NS71 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GKN1Q9NS71 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GKN1Q9NS71 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
GKN1Q9NS71 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GKN1Q9NS71 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GKN1Q9NS71 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GKN1Q9NS71 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GKN1Q9NS71 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GKN1Q9NS71 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GKN1Q9NS71 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GKN1Q9NS71 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GKN1Q9NS71 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GKN1Q9NS71 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GKN1Q9NS71 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GKN1Q9NS71 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GKN1Q9NS71 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GKN1Q9NS71 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GKN1Q9NS71 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GKN1Q9NS71 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GKN1Q9NS71 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GKN1Q9NS71 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GKN1Q9NS71 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GKN1Q9NS71 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GKN1Q9NS71 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GKN1Q9NS71 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GKN1Q9NS71 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GKN1Q9NS71 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GKN1Q9NS71 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GKN1Q9NS71 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
GKN1Q9NS71 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GKN1Q9NS71 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GKN1Q9NS71 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GKN1Q9NS71 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
GKN1Q9NS71 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GKN1Q9NS71 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GKN1Q9NS71 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GKN1Q9NS71 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GKN1Q9NS71 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
GKN1Q9NS71 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GKN1Q9NS71 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GKN1Q9NS71 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GKN1Q9NS71 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GKN1Q9NS71 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GKN1Q9NS71 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GKN1Q9NS71 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GKN1Q9NS71 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GKN1Q9NS71 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GKN1Q9NS71 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GKN1Q9NS71 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GKN1Q9NS71 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GKN1Q9NS71 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GKN1Q9NS71 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GKN1Q9NS71 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GKN1Q9NS71 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GKN1Q9NS71 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GKN1Q9NS71 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GKN1Q9NS71 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GKN1Q9NS71 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GKN1Q9NS71 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GKN1Q9NS71 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GKN1Q9NS71 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GKN1Q9NS71 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GKN1Q9NS71 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
GKN1Q9NS71 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GKN1Q9NS71 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GKN1Q9NS71 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GKN1Q9NS71 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
GKN1Q9NS71 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GKN1Q9NS71 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GKN1Q9NS71 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GKN1Q9NS71 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GKN1Q9NS71 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GKN1Q9NS71 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GKN1Q9NS71 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GKN1Q9NS71 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GKN1Q9NS71 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GKN1Q9NS71 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GKN1Q9NS71 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GKN1Q9NS71 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GKN1Q9NS71 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GKN1Q9NS71 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms