Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX3

NDUFA4L2, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 4-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 87 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA4L2Q9NRX3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NDUFA4L2Q9NRX3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NDUFA4L2Q9NRX3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NDUFA4L2Q9NRX3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NDUFA4L2Q9NRX3 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
NDUFA4L2Q9NRX3 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NDUFA4L2Q9NRX3 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NDUFA4L2Q9NRX3 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NDUFA4L2Q9NRX3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NDUFA4L2Q9NRX3 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NDUFA4L2Q9NRX3 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NDUFA4L2Q9NRX3 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NDUFA4L2Q9NRX3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NDUFA4L2Q9NRX3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NDUFA4L2Q9NRX3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NDUFA4L2Q9NRX3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
NDUFA4L2Q9NRX3 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NDUFA4L2Q9NRX3 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NDUFA4L2Q9NRX3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
NDUFA4L2Q9NRX3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NDUFA4L2Q9NRX3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NDUFA4L2Q9NRX3 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NDUFA4L2Q9NRX3 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NDUFA4L2Q9NRX3 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NDUFA4L2Q9NRX3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NDUFA4L2Q9NRX3 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NDUFA4L2Q9NRX3 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NDUFA4L2Q9NRX3 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NDUFA4L2Q9NRX3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NDUFA4L2Q9NRX3 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NDUFA4L2Q9NRX3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
NDUFA4L2Q9NRX3 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NDUFA4L2Q9NRX3 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NDUFA4L2Q9NRX3 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NDUFA4L2Q9NRX3 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NDUFA4L2Q9NRX3 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NDUFA4L2Q9NRX3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NDUFA4L2Q9NRX3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NDUFA4L2Q9NRX3 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
NDUFA4L2Q9NRX3 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
NDUFA4L2Q9NRX3 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NDUFA4L2Q9NRX3 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NDUFA4L2Q9NRX3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NDUFA4L2Q9NRX3 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
NDUFA4L2Q9NRX3 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NDUFA4L2Q9NRX3 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NDUFA4L2Q9NRX3 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NDUFA4L2Q9NRX3 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NDUFA4L2Q9NRX3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NDUFA4L2Q9NRX3 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NDUFA4L2Q9NRX3 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NDUFA4L2Q9NRX3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NDUFA4L2Q9NRX3 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NDUFA4L2Q9NRX3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NDUFA4L2Q9NRX3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NDUFA4L2Q9NRX3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NDUFA4L2Q9NRX3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NDUFA4L2Q9NRX3 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NDUFA4L2Q9NRX3 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NDUFA4L2Q9NRX3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NDUFA4L2Q9NRX3 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NDUFA4L2Q9NRX3 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NDUFA4L2Q9NRX3 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NDUFA4L2Q9NRX3 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NDUFA4L2Q9NRX3 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NDUFA4L2Q9NRX3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NDUFA4L2Q9NRX3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NDUFA4L2Q9NRX3 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NDUFA4L2Q9NRX3 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NDUFA4L2Q9NRX3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NDUFA4L2Q9NRX3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NDUFA4L2Q9NRX3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NDUFA4L2Q9NRX3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NDUFA4L2Q9NRX3 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NDUFA4L2Q9NRX3 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NDUFA4L2Q9NRX3 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NDUFA4L2Q9NRX3 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NDUFA4L2Q9NRX3 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NDUFA4L2Q9NRX3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NDUFA4L2Q9NRX3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NDUFA4L2Q9NRX3 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NDUFA4L2Q9NRX3 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NDUFA4L2Q9NRX3 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NDUFA4L2Q9NRX3 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NDUFA4L2Q9NRX3 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NDUFA4L2Q9NRX3 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NDUFA4L2Q9NRX3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NDUFA4L2Q9NRX3 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NDUFA4L2Q9NRX3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
NDUFA4L2Q9NRX3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NDUFA4L2Q9NRX3 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NDUFA4L2Q9NRX3 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NDUFA4L2Q9NRX3 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NDUFA4L2Q9NRX3 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NDUFA4L2Q9NRX3 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NDUFA4L2Q9NRX3 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NDUFA4L2Q9NRX3 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NDUFA4L2Q9NRX3 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NDUFA4L2Q9NRX3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NDUFA4L2Q9NRX3 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms