Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRA0

SPHK2, Sphingosine kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHK2Q9NRA0 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPHK2Q9NRA0 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPHK2Q9NRA0 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPHK2Q9NRA0 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPHK2Q9NRA0 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SPHK2Q9NRA0 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SPHK2Q9NRA0 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SPHK2Q9NRA0 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SPHK2Q9NRA0 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SPHK2Q9NRA0 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SPHK2Q9NRA0 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SPHK2Q9NRA0 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SPHK2Q9NRA0 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SPHK2Q9NRA0 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPHK2Q9NRA0 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPHK2Q9NRA0 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPHK2Q9NRA0 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SPHK2Q9NRA0 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPHK2Q9NRA0 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPHK2Q9NRA0 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPHK2Q9NRA0 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPHK2Q9NRA0 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPHK2Q9NRA0 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPHK2Q9NRA0 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SPHK2Q9NRA0 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPHK2Q9NRA0 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPHK2Q9NRA0 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPHK2Q9NRA0 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPHK2Q9NRA0 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPHK2Q9NRA0 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPHK2Q9NRA0 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPHK2Q9NRA0 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPHK2Q9NRA0 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPHK2Q9NRA0 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPHK2Q9NRA0 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPHK2Q9NRA0 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPHK2Q9NRA0 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPHK2Q9NRA0 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPHK2Q9NRA0 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPHK2Q9NRA0 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPHK2Q9NRA0 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPHK2Q9NRA0 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPHK2Q9NRA0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPHK2Q9NRA0 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPHK2Q9NRA0 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SPHK2Q9NRA0 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPHK2Q9NRA0 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SPHK2Q9NRA0 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPHK2Q9NRA0 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPHK2Q9NRA0 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPHK2Q9NRA0 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SPHK2Q9NRA0 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPHK2Q9NRA0 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPHK2Q9NRA0 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPHK2Q9NRA0 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SPHK2Q9NRA0 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPHK2Q9NRA0 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPHK2Q9NRA0 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPHK2Q9NRA0 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SPHK2Q9NRA0 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SPHK2Q9NRA0 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SPHK2Q9NRA0 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SPHK2Q9NRA0 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SPHK2Q9NRA0 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SPHK2Q9NRA0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SPHK2Q9NRA0 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SPHK2Q9NRA0 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPHK2Q9NRA0 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPHK2Q9NRA0 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPHK2Q9NRA0 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPHK2Q9NRA0 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPHK2Q9NRA0 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPHK2Q9NRA0 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPHK2Q9NRA0 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPHK2Q9NRA0 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPHK2Q9NRA0 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPHK2Q9NRA0 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPHK2Q9NRA0 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPHK2Q9NRA0 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPHK2Q9NRA0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPHK2Q9NRA0 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPHK2Q9NRA0 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPHK2Q9NRA0 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPHK2Q9NRA0 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPHK2Q9NRA0 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPHK2Q9NRA0 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPHK2Q9NRA0 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPHK2Q9NRA0 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPHK2Q9NRA0 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPHK2Q9NRA0 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SPHK2Q9NRA0 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPHK2Q9NRA0 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPHK2Q9NRA0 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPHK2Q9NRA0 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPHK2Q9NRA0 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPHK2Q9NRA0 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPHK2Q9NRA0 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SPHK2Q9NRA0 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPHK2Q9NRA0 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPHK2Q9NRA0 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms