Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR16

CD163L1, Scavenger receptor cysteine-rich type 1 protein M160, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD163L1Q9NR16 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
CD163L1Q9NR16 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
CD163L1Q9NR16 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
CD163L1Q9NR16 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
CD163L1Q9NR16 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
CD163L1Q9NR16 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
CD163L1Q9NR16 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
CD163L1Q9NR16 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
CD163L1Q9NR16 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
CD163L1Q9NR16 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
CD163L1Q9NR16 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
CD163L1Q9NR16 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
CD163L1Q9NR16 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
CD163L1Q9NR16 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
CD163L1Q9NR16 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
CD163L1Q9NR16 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
CD163L1Q9NR16 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
CD163L1Q9NR16 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
CD163L1Q9NR16 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
CD163L1Q9NR16 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
CD163L1Q9NR16 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
CD163L1Q9NR16 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
CD163L1Q9NR16 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
CD163L1Q9NR16 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
CD163L1Q9NR16 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
CD163L1Q9NR16 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
CD163L1Q9NR16 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
CD163L1Q9NR16 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
CD163L1Q9NR16 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
CD163L1Q9NR16 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
CD163L1Q9NR16 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
CD163L1Q9NR16 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
CD163L1Q9NR16 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
CD163L1Q9NR16 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
CD163L1Q9NR16 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
CD163L1Q9NR16 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
CD163L1Q9NR16 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
CD163L1Q9NR16 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
CD163L1Q9NR16 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
CD163L1Q9NR16 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
CD163L1Q9NR16 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
CD163L1Q9NR16 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
CD163L1Q9NR16 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
CD163L1Q9NR16 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
CD163L1Q9NR16 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
CD163L1Q9NR16 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
CD163L1Q9NR16 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC31.55■■■□□ 2.64
CD163L1Q9NR16 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC31.55■■■□□ 2.64
CD163L1Q9NR16 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC31.55■■■□□ 2.64
CD163L1Q9NR16 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
CD163L1Q9NR16 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
CD163L1Q9NR16 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC31.55■■■□□ 2.64
CD163L1Q9NR16 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
CD163L1Q9NR16 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
CD163L1Q9NR16 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
CD163L1Q9NR16 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
CD163L1Q9NR16 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
CD163L1Q9NR16 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
CD163L1Q9NR16 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
CD163L1Q9NR16 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
CD163L1Q9NR16 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
CD163L1Q9NR16 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC31.53■■■□□ 2.64
CD163L1Q9NR16 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
CD163L1Q9NR16 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
CD163L1Q9NR16 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
CD163L1Q9NR16 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
CD163L1Q9NR16 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
CD163L1Q9NR16 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
CD163L1Q9NR16 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
CD163L1Q9NR16 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
CD163L1Q9NR16 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC31.52■■■□□ 2.64
CD163L1Q9NR16 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
CD163L1Q9NR16 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
CD163L1Q9NR16 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
CD163L1Q9NR16 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
CD163L1Q9NR16 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
CD163L1Q9NR16 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
CD163L1Q9NR16 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
CD163L1Q9NR16 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
CD163L1Q9NR16 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
CD163L1Q9NR16 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
CD163L1Q9NR16 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC31.51■■■□□ 2.63
CD163L1Q9NR16 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC31.51■■■□□ 2.63
CD163L1Q9NR16 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
CD163L1Q9NR16 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
CD163L1Q9NR16 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
CD163L1Q9NR16 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
CD163L1Q9NR16 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC31.5■■■□□ 2.63
CD163L1Q9NR16 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
CD163L1Q9NR16 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC31.5■■■□□ 2.63
CD163L1Q9NR16 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
CD163L1Q9NR16 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
CD163L1Q9NR16 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
CD163L1Q9NR16 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
CD163L1Q9NR16 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
CD163L1Q9NR16 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
CD163L1Q9NR16 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
CD163L1Q9NR16 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
CD163L1Q9NR16 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
CD163L1Q9NR16 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms