Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPP4

NLRC4, NLR family CARD domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRC4Q9NPP4 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NLRC4Q9NPP4 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NLRC4Q9NPP4 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NLRC4Q9NPP4 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NLRC4Q9NPP4 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NLRC4Q9NPP4 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NLRC4Q9NPP4 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NLRC4Q9NPP4 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NLRC4Q9NPP4 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NLRC4Q9NPP4 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NLRC4Q9NPP4 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NLRC4Q9NPP4 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NLRC4Q9NPP4 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NLRC4Q9NPP4 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NLRC4Q9NPP4 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NLRC4Q9NPP4 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NLRC4Q9NPP4 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NLRC4Q9NPP4 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NLRC4Q9NPP4 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NLRC4Q9NPP4 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NLRC4Q9NPP4 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NLRC4Q9NPP4 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NLRC4Q9NPP4 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NLRC4Q9NPP4 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NLRC4Q9NPP4 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NLRC4Q9NPP4 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
NLRC4Q9NPP4 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NLRC4Q9NPP4 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NLRC4Q9NPP4 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NLRC4Q9NPP4 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NLRC4Q9NPP4 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NLRC4Q9NPP4 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NLRC4Q9NPP4 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NLRC4Q9NPP4 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NLRC4Q9NPP4 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NLRC4Q9NPP4 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NLRC4Q9NPP4 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NLRC4Q9NPP4 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NLRC4Q9NPP4 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NLRC4Q9NPP4 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NLRC4Q9NPP4 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NLRC4Q9NPP4 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NLRC4Q9NPP4 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
NLRC4Q9NPP4 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NLRC4Q9NPP4 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NLRC4Q9NPP4 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NLRC4Q9NPP4 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
NLRC4Q9NPP4 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NLRC4Q9NPP4 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NLRC4Q9NPP4 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NLRC4Q9NPP4 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NLRC4Q9NPP4 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NLRC4Q9NPP4 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
NLRC4Q9NPP4 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NLRC4Q9NPP4 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NLRC4Q9NPP4 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NLRC4Q9NPP4 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NLRC4Q9NPP4 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NLRC4Q9NPP4 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NLRC4Q9NPP4 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NLRC4Q9NPP4 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NLRC4Q9NPP4 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NLRC4Q9NPP4 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NLRC4Q9NPP4 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NLRC4Q9NPP4 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NLRC4Q9NPP4 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NLRC4Q9NPP4 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NLRC4Q9NPP4 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NLRC4Q9NPP4 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NLRC4Q9NPP4 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NLRC4Q9NPP4 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NLRC4Q9NPP4 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
NLRC4Q9NPP4 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NLRC4Q9NPP4 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NLRC4Q9NPP4 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NLRC4Q9NPP4 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NLRC4Q9NPP4 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NLRC4Q9NPP4 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
NLRC4Q9NPP4 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NLRC4Q9NPP4 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NLRC4Q9NPP4 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NLRC4Q9NPP4 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NLRC4Q9NPP4 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NLRC4Q9NPP4 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NLRC4Q9NPP4 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NLRC4Q9NPP4 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NLRC4Q9NPP4 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NLRC4Q9NPP4 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NLRC4Q9NPP4 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NLRC4Q9NPP4 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NLRC4Q9NPP4 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NLRC4Q9NPP4 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
NLRC4Q9NPP4 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NLRC4Q9NPP4 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
NLRC4Q9NPP4 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NLRC4Q9NPP4 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NLRC4Q9NPP4 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NLRC4Q9NPP4 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NLRC4Q9NPP4 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NLRC4Q9NPP4 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms