Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG4

PCDH12, Protocadherin-12, humanhuman

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH12Q9NPG4 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCDH12Q9NPG4 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCDH12Q9NPG4 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCDH12Q9NPG4 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCDH12Q9NPG4 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCDH12Q9NPG4 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PCDH12Q9NPG4 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PCDH12Q9NPG4 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCDH12Q9NPG4 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCDH12Q9NPG4 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCDH12Q9NPG4 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCDH12Q9NPG4 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCDH12Q9NPG4 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCDH12Q9NPG4 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCDH12Q9NPG4 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCDH12Q9NPG4 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCDH12Q9NPG4 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCDH12Q9NPG4 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PCDH12Q9NPG4 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PCDH12Q9NPG4 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PCDH12Q9NPG4 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PCDH12Q9NPG4 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PCDH12Q9NPG4 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCDH12Q9NPG4 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCDH12Q9NPG4 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCDH12Q9NPG4 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCDH12Q9NPG4 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCDH12Q9NPG4 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCDH12Q9NPG4 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCDH12Q9NPG4 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCDH12Q9NPG4 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCDH12Q9NPG4 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCDH12Q9NPG4 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCDH12Q9NPG4 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCDH12Q9NPG4 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCDH12Q9NPG4 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCDH12Q9NPG4 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCDH12Q9NPG4 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCDH12Q9NPG4 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCDH12Q9NPG4 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCDH12Q9NPG4 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCDH12Q9NPG4 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PCDH12Q9NPG4 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCDH12Q9NPG4 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCDH12Q9NPG4 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCDH12Q9NPG4 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCDH12Q9NPG4 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCDH12Q9NPG4 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCDH12Q9NPG4 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCDH12Q9NPG4 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCDH12Q9NPG4 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCDH12Q9NPG4 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCDH12Q9NPG4 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCDH12Q9NPG4 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCDH12Q9NPG4 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCDH12Q9NPG4 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCDH12Q9NPG4 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCDH12Q9NPG4 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCDH12Q9NPG4 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCDH12Q9NPG4 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCDH12Q9NPG4 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCDH12Q9NPG4 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCDH12Q9NPG4 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCDH12Q9NPG4 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCDH12Q9NPG4 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCDH12Q9NPG4 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCDH12Q9NPG4 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCDH12Q9NPG4 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCDH12Q9NPG4 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCDH12Q9NPG4 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCDH12Q9NPG4 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PCDH12Q9NPG4 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PCDH12Q9NPG4 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PCDH12Q9NPG4 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCDH12Q9NPG4 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCDH12Q9NPG4 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCDH12Q9NPG4 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCDH12Q9NPG4 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCDH12Q9NPG4 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PCDH12Q9NPG4 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCDH12Q9NPG4 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCDH12Q9NPG4 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCDH12Q9NPG4 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCDH12Q9NPG4 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCDH12Q9NPG4 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCDH12Q9NPG4 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCDH12Q9NPG4 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCDH12Q9NPG4 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCDH12Q9NPG4 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCDH12Q9NPG4 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCDH12Q9NPG4 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCDH12Q9NPG4 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCDH12Q9NPG4 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCDH12Q9NPG4 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCDH12Q9NPG4 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PCDH12Q9NPG4 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCDH12Q9NPG4 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCDH12Q9NPG4 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCDH12Q9NPG4 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCDH12Q9NPG4 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms