Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPB6

PARD6A, Partitioning defective 6 homolog alpha, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARD6AQ9NPB6 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PARD6AQ9NPB6 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PARD6AQ9NPB6 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PARD6AQ9NPB6 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PARD6AQ9NPB6 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PARD6AQ9NPB6 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PARD6AQ9NPB6 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PARD6AQ9NPB6 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PARD6AQ9NPB6 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PARD6AQ9NPB6 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PARD6AQ9NPB6 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PARD6AQ9NPB6 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PARD6AQ9NPB6 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PARD6AQ9NPB6 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PARD6AQ9NPB6 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PARD6AQ9NPB6 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PARD6AQ9NPB6 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PARD6AQ9NPB6 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PARD6AQ9NPB6 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PARD6AQ9NPB6 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PARD6AQ9NPB6 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PARD6AQ9NPB6 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PARD6AQ9NPB6 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PARD6AQ9NPB6 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PARD6AQ9NPB6 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PARD6AQ9NPB6 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PARD6AQ9NPB6 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PARD6AQ9NPB6 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PARD6AQ9NPB6 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PARD6AQ9NPB6 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PARD6AQ9NPB6 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PARD6AQ9NPB6 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PARD6AQ9NPB6 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PARD6AQ9NPB6 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PARD6AQ9NPB6 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PARD6AQ9NPB6 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PARD6AQ9NPB6 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PARD6AQ9NPB6 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PARD6AQ9NPB6 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PARD6AQ9NPB6 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PARD6AQ9NPB6 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PARD6AQ9NPB6 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PARD6AQ9NPB6 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PARD6AQ9NPB6 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PARD6AQ9NPB6 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PARD6AQ9NPB6 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PARD6AQ9NPB6 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PARD6AQ9NPB6 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PARD6AQ9NPB6 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PARD6AQ9NPB6 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PARD6AQ9NPB6 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PARD6AQ9NPB6 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PARD6AQ9NPB6 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PARD6AQ9NPB6 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PARD6AQ9NPB6 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PARD6AQ9NPB6 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PARD6AQ9NPB6 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PARD6AQ9NPB6 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PARD6AQ9NPB6 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PARD6AQ9NPB6 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PARD6AQ9NPB6 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PARD6AQ9NPB6 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PARD6AQ9NPB6 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PARD6AQ9NPB6 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PARD6AQ9NPB6 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PARD6AQ9NPB6 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PARD6AQ9NPB6 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PARD6AQ9NPB6 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PARD6AQ9NPB6 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PARD6AQ9NPB6 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PARD6AQ9NPB6 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PARD6AQ9NPB6 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PARD6AQ9NPB6 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PARD6AQ9NPB6 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PARD6AQ9NPB6 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PARD6AQ9NPB6 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PARD6AQ9NPB6 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PARD6AQ9NPB6 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PARD6AQ9NPB6 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PARD6AQ9NPB6 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PARD6AQ9NPB6 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PARD6AQ9NPB6 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PARD6AQ9NPB6 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PARD6AQ9NPB6 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PARD6AQ9NPB6 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PARD6AQ9NPB6 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PARD6AQ9NPB6 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PARD6AQ9NPB6 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PARD6AQ9NPB6 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PARD6AQ9NPB6 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PARD6AQ9NPB6 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PARD6AQ9NPB6 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PARD6AQ9NPB6 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PARD6AQ9NPB6 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PARD6AQ9NPB6 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PARD6AQ9NPB6 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PARD6AQ9NPB6 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PARD6AQ9NPB6 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PARD6AQ9NPB6 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PARD6AQ9NPB6 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms