Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD26

GOPC, Golgi-associated PDZ and coiled-coil motif-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOPCQ9HD26 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GOPCQ9HD26 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GOPCQ9HD26 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GOPCQ9HD26 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GOPCQ9HD26 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GOPCQ9HD26 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GOPCQ9HD26 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GOPCQ9HD26 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GOPCQ9HD26 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GOPCQ9HD26 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GOPCQ9HD26 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GOPCQ9HD26 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GOPCQ9HD26 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GOPCQ9HD26 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GOPCQ9HD26 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GOPCQ9HD26 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GOPCQ9HD26 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GOPCQ9HD26 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GOPCQ9HD26 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GOPCQ9HD26 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GOPCQ9HD26 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GOPCQ9HD26 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GOPCQ9HD26 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GOPCQ9HD26 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GOPCQ9HD26 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GOPCQ9HD26 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GOPCQ9HD26 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GOPCQ9HD26 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GOPCQ9HD26 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GOPCQ9HD26 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GOPCQ9HD26 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GOPCQ9HD26 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GOPCQ9HD26 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GOPCQ9HD26 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GOPCQ9HD26 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GOPCQ9HD26 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GOPCQ9HD26 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
GOPCQ9HD26 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GOPCQ9HD26 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GOPCQ9HD26 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GOPCQ9HD26 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GOPCQ9HD26 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GOPCQ9HD26 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GOPCQ9HD26 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GOPCQ9HD26 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GOPCQ9HD26 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GOPCQ9HD26 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GOPCQ9HD26 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GOPCQ9HD26 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GOPCQ9HD26 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GOPCQ9HD26 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GOPCQ9HD26 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GOPCQ9HD26 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GOPCQ9HD26 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
GOPCQ9HD26 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GOPCQ9HD26 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GOPCQ9HD26 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GOPCQ9HD26 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GOPCQ9HD26 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GOPCQ9HD26 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GOPCQ9HD26 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GOPCQ9HD26 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GOPCQ9HD26 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GOPCQ9HD26 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GOPCQ9HD26 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GOPCQ9HD26 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GOPCQ9HD26 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
GOPCQ9HD26 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GOPCQ9HD26 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GOPCQ9HD26 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GOPCQ9HD26 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GOPCQ9HD26 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GOPCQ9HD26 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GOPCQ9HD26 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
GOPCQ9HD26 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
GOPCQ9HD26 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GOPCQ9HD26 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GOPCQ9HD26 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GOPCQ9HD26 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GOPCQ9HD26 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GOPCQ9HD26 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GOPCQ9HD26 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GOPCQ9HD26 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GOPCQ9HD26 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GOPCQ9HD26 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GOPCQ9HD26 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GOPCQ9HD26 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GOPCQ9HD26 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GOPCQ9HD26 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GOPCQ9HD26 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
GOPCQ9HD26 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
GOPCQ9HD26 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GOPCQ9HD26 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GOPCQ9HD26 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GOPCQ9HD26 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GOPCQ9HD26 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GOPCQ9HD26 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GOPCQ9HD26 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GOPCQ9HD26 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GOPCQ9HD26 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92 ms