Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Z2

LIN28A, Protein lin-28 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN28AQ9H9Z2 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LIN28AQ9H9Z2 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LIN28AQ9H9Z2 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LIN28AQ9H9Z2 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LIN28AQ9H9Z2 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LIN28AQ9H9Z2 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LIN28AQ9H9Z2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LIN28AQ9H9Z2 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
LIN28AQ9H9Z2 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
LIN28AQ9H9Z2 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LIN28AQ9H9Z2 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LIN28AQ9H9Z2 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LIN28AQ9H9Z2 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LIN28AQ9H9Z2 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LIN28AQ9H9Z2 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LIN28AQ9H9Z2 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LIN28AQ9H9Z2 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LIN28AQ9H9Z2 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LIN28AQ9H9Z2 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LIN28AQ9H9Z2 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LIN28AQ9H9Z2 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LIN28AQ9H9Z2 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LIN28AQ9H9Z2 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LIN28AQ9H9Z2 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LIN28AQ9H9Z2 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LIN28AQ9H9Z2 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LIN28AQ9H9Z2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LIN28AQ9H9Z2 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LIN28AQ9H9Z2 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LIN28AQ9H9Z2 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LIN28AQ9H9Z2 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LIN28AQ9H9Z2 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LIN28AQ9H9Z2 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LIN28AQ9H9Z2 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LIN28AQ9H9Z2 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LIN28AQ9H9Z2 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LIN28AQ9H9Z2 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LIN28AQ9H9Z2 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LIN28AQ9H9Z2 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LIN28AQ9H9Z2 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LIN28AQ9H9Z2 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LIN28AQ9H9Z2 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LIN28AQ9H9Z2 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LIN28AQ9H9Z2 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LIN28AQ9H9Z2 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
LIN28AQ9H9Z2 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LIN28AQ9H9Z2 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LIN28AQ9H9Z2 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LIN28AQ9H9Z2 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LIN28AQ9H9Z2 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LIN28AQ9H9Z2 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LIN28AQ9H9Z2 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
LIN28AQ9H9Z2 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LIN28AQ9H9Z2 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
LIN28AQ9H9Z2 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
LIN28AQ9H9Z2 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
LIN28AQ9H9Z2 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
LIN28AQ9H9Z2 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LIN28AQ9H9Z2 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
LIN28AQ9H9Z2 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LIN28AQ9H9Z2 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
LIN28AQ9H9Z2 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LIN28AQ9H9Z2 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LIN28AQ9H9Z2 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LIN28AQ9H9Z2 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LIN28AQ9H9Z2 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LIN28AQ9H9Z2 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
LIN28AQ9H9Z2 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LIN28AQ9H9Z2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LIN28AQ9H9Z2 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LIN28AQ9H9Z2 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LIN28AQ9H9Z2 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LIN28AQ9H9Z2 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LIN28AQ9H9Z2 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LIN28AQ9H9Z2 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LIN28AQ9H9Z2 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LIN28AQ9H9Z2 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LIN28AQ9H9Z2 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LIN28AQ9H9Z2 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LIN28AQ9H9Z2 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LIN28AQ9H9Z2 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LIN28AQ9H9Z2 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LIN28AQ9H9Z2 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
LIN28AQ9H9Z2 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
LIN28AQ9H9Z2 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LIN28AQ9H9Z2 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LIN28AQ9H9Z2 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LIN28AQ9H9Z2 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LIN28AQ9H9Z2 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LIN28AQ9H9Z2 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LIN28AQ9H9Z2 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LIN28AQ9H9Z2 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LIN28AQ9H9Z2 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LIN28AQ9H9Z2 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LIN28AQ9H9Z2 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
LIN28AQ9H9Z2 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LIN28AQ9H9Z2 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LIN28AQ9H9Z2 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
LIN28AQ9H9Z2 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LIN28AQ9H9Z2 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
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