Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Q2

COPS7B, COP9 signalosome complex subunit 7b, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7BQ9H9Q2 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COPS7BQ9H9Q2 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COPS7BQ9H9Q2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COPS7BQ9H9Q2 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COPS7BQ9H9Q2 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COPS7BQ9H9Q2 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COPS7BQ9H9Q2 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COPS7BQ9H9Q2 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COPS7BQ9H9Q2 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COPS7BQ9H9Q2 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COPS7BQ9H9Q2 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COPS7BQ9H9Q2 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COPS7BQ9H9Q2 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COPS7BQ9H9Q2 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COPS7BQ9H9Q2 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COPS7BQ9H9Q2 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COPS7BQ9H9Q2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COPS7BQ9H9Q2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COPS7BQ9H9Q2 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COPS7BQ9H9Q2 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COPS7BQ9H9Q2 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
COPS7BQ9H9Q2 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
COPS7BQ9H9Q2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
COPS7BQ9H9Q2 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
COPS7BQ9H9Q2 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
COPS7BQ9H9Q2 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
COPS7BQ9H9Q2 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
COPS7BQ9H9Q2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
COPS7BQ9H9Q2 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
COPS7BQ9H9Q2 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COPS7BQ9H9Q2 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COPS7BQ9H9Q2 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COPS7BQ9H9Q2 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COPS7BQ9H9Q2 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COPS7BQ9H9Q2 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COPS7BQ9H9Q2 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COPS7BQ9H9Q2 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COPS7BQ9H9Q2 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COPS7BQ9H9Q2 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COPS7BQ9H9Q2 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COPS7BQ9H9Q2 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COPS7BQ9H9Q2 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COPS7BQ9H9Q2 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COPS7BQ9H9Q2 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COPS7BQ9H9Q2 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COPS7BQ9H9Q2 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COPS7BQ9H9Q2 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
COPS7BQ9H9Q2 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COPS7BQ9H9Q2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COPS7BQ9H9Q2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COPS7BQ9H9Q2 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COPS7BQ9H9Q2 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COPS7BQ9H9Q2 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COPS7BQ9H9Q2 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COPS7BQ9H9Q2 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COPS7BQ9H9Q2 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COPS7BQ9H9Q2 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COPS7BQ9H9Q2 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COPS7BQ9H9Q2 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COPS7BQ9H9Q2 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
COPS7BQ9H9Q2 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COPS7BQ9H9Q2 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COPS7BQ9H9Q2 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COPS7BQ9H9Q2 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COPS7BQ9H9Q2 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COPS7BQ9H9Q2 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COPS7BQ9H9Q2 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COPS7BQ9H9Q2 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COPS7BQ9H9Q2 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COPS7BQ9H9Q2 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COPS7BQ9H9Q2 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
COPS7BQ9H9Q2 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COPS7BQ9H9Q2 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COPS7BQ9H9Q2 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COPS7BQ9H9Q2 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COPS7BQ9H9Q2 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COPS7BQ9H9Q2 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COPS7BQ9H9Q2 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COPS7BQ9H9Q2 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COPS7BQ9H9Q2 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COPS7BQ9H9Q2 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COPS7BQ9H9Q2 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COPS7BQ9H9Q2 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COPS7BQ9H9Q2 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
COPS7BQ9H9Q2 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
COPS7BQ9H9Q2 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COPS7BQ9H9Q2 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
COPS7BQ9H9Q2 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COPS7BQ9H9Q2 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COPS7BQ9H9Q2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COPS7BQ9H9Q2 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COPS7BQ9H9Q2 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COPS7BQ9H9Q2 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COPS7BQ9H9Q2 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COPS7BQ9H9Q2 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COPS7BQ9H9Q2 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
COPS7BQ9H9Q2 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COPS7BQ9H9Q2 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COPS7BQ9H9Q2 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COPS7BQ9H9Q2 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms