Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9C1

VIPAS39, Spermatogenesis-defective protein 39 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIPAS39Q9H9C1 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
VIPAS39Q9H9C1 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VIPAS39Q9H9C1 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
VIPAS39Q9H9C1 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
VIPAS39Q9H9C1 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
VIPAS39Q9H9C1 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
VIPAS39Q9H9C1 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
VIPAS39Q9H9C1 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VIPAS39Q9H9C1 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
VIPAS39Q9H9C1 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VIPAS39Q9H9C1 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VIPAS39Q9H9C1 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VIPAS39Q9H9C1 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VIPAS39Q9H9C1 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VIPAS39Q9H9C1 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VIPAS39Q9H9C1 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VIPAS39Q9H9C1 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VIPAS39Q9H9C1 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VIPAS39Q9H9C1 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VIPAS39Q9H9C1 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VIPAS39Q9H9C1 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VIPAS39Q9H9C1 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VIPAS39Q9H9C1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VIPAS39Q9H9C1 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
VIPAS39Q9H9C1 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VIPAS39Q9H9C1 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VIPAS39Q9H9C1 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VIPAS39Q9H9C1 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VIPAS39Q9H9C1 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
VIPAS39Q9H9C1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VIPAS39Q9H9C1 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VIPAS39Q9H9C1 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VIPAS39Q9H9C1 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VIPAS39Q9H9C1 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VIPAS39Q9H9C1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VIPAS39Q9H9C1 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VIPAS39Q9H9C1 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VIPAS39Q9H9C1 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VIPAS39Q9H9C1 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VIPAS39Q9H9C1 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VIPAS39Q9H9C1 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
VIPAS39Q9H9C1 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
VIPAS39Q9H9C1 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VIPAS39Q9H9C1 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VIPAS39Q9H9C1 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VIPAS39Q9H9C1 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
VIPAS39Q9H9C1 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VIPAS39Q9H9C1 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
VIPAS39Q9H9C1 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
VIPAS39Q9H9C1 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VIPAS39Q9H9C1 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VIPAS39Q9H9C1 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VIPAS39Q9H9C1 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VIPAS39Q9H9C1 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VIPAS39Q9H9C1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VIPAS39Q9H9C1 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VIPAS39Q9H9C1 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VIPAS39Q9H9C1 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VIPAS39Q9H9C1 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VIPAS39Q9H9C1 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VIPAS39Q9H9C1 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VIPAS39Q9H9C1 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VIPAS39Q9H9C1 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
VIPAS39Q9H9C1 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VIPAS39Q9H9C1 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
VIPAS39Q9H9C1 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
VIPAS39Q9H9C1 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
VIPAS39Q9H9C1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
VIPAS39Q9H9C1 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VIPAS39Q9H9C1 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VIPAS39Q9H9C1 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VIPAS39Q9H9C1 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VIPAS39Q9H9C1 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VIPAS39Q9H9C1 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VIPAS39Q9H9C1 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VIPAS39Q9H9C1 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VIPAS39Q9H9C1 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VIPAS39Q9H9C1 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VIPAS39Q9H9C1 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VIPAS39Q9H9C1 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VIPAS39Q9H9C1 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VIPAS39Q9H9C1 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VIPAS39Q9H9C1 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VIPAS39Q9H9C1 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VIPAS39Q9H9C1 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VIPAS39Q9H9C1 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VIPAS39Q9H9C1 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VIPAS39Q9H9C1 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VIPAS39Q9H9C1 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
VIPAS39Q9H9C1 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VIPAS39Q9H9C1 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VIPAS39Q9H9C1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VIPAS39Q9H9C1 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VIPAS39Q9H9C1 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VIPAS39Q9H9C1 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VIPAS39Q9H9C1 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VIPAS39Q9H9C1 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VIPAS39Q9H9C1 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VIPAS39Q9H9C1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VIPAS39Q9H9C1 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms