Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7Z3

NRDE2, Protein NRDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRDE2Q9H7Z3 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NRDE2Q9H7Z3 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NRDE2Q9H7Z3 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NRDE2Q9H7Z3 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
NRDE2Q9H7Z3 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NRDE2Q9H7Z3 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NRDE2Q9H7Z3 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NRDE2Q9H7Z3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NRDE2Q9H7Z3 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NRDE2Q9H7Z3 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NRDE2Q9H7Z3 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NRDE2Q9H7Z3 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NRDE2Q9H7Z3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NRDE2Q9H7Z3 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NRDE2Q9H7Z3 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NRDE2Q9H7Z3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NRDE2Q9H7Z3 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
NRDE2Q9H7Z3 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NRDE2Q9H7Z3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NRDE2Q9H7Z3 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NRDE2Q9H7Z3 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NRDE2Q9H7Z3 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NRDE2Q9H7Z3 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
NRDE2Q9H7Z3 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NRDE2Q9H7Z3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NRDE2Q9H7Z3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NRDE2Q9H7Z3 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NRDE2Q9H7Z3 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
NRDE2Q9H7Z3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NRDE2Q9H7Z3 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NRDE2Q9H7Z3 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NRDE2Q9H7Z3 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NRDE2Q9H7Z3 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NRDE2Q9H7Z3 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NRDE2Q9H7Z3 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NRDE2Q9H7Z3 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NRDE2Q9H7Z3 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NRDE2Q9H7Z3 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
NRDE2Q9H7Z3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NRDE2Q9H7Z3 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NRDE2Q9H7Z3 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NRDE2Q9H7Z3 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NRDE2Q9H7Z3 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NRDE2Q9H7Z3 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NRDE2Q9H7Z3 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NRDE2Q9H7Z3 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NRDE2Q9H7Z3 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NRDE2Q9H7Z3 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NRDE2Q9H7Z3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NRDE2Q9H7Z3 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NRDE2Q9H7Z3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NRDE2Q9H7Z3 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NRDE2Q9H7Z3 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NRDE2Q9H7Z3 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NRDE2Q9H7Z3 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NRDE2Q9H7Z3 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NRDE2Q9H7Z3 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NRDE2Q9H7Z3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NRDE2Q9H7Z3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NRDE2Q9H7Z3 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
NRDE2Q9H7Z3 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
NRDE2Q9H7Z3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NRDE2Q9H7Z3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NRDE2Q9H7Z3 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NRDE2Q9H7Z3 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NRDE2Q9H7Z3 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NRDE2Q9H7Z3 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NRDE2Q9H7Z3 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NRDE2Q9H7Z3 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NRDE2Q9H7Z3 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NRDE2Q9H7Z3 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NRDE2Q9H7Z3 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NRDE2Q9H7Z3 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
NRDE2Q9H7Z3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NRDE2Q9H7Z3 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NRDE2Q9H7Z3 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NRDE2Q9H7Z3 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NRDE2Q9H7Z3 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NRDE2Q9H7Z3 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NRDE2Q9H7Z3 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NRDE2Q9H7Z3 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
NRDE2Q9H7Z3 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
NRDE2Q9H7Z3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NRDE2Q9H7Z3 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NRDE2Q9H7Z3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
NRDE2Q9H7Z3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NRDE2Q9H7Z3 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NRDE2Q9H7Z3 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NRDE2Q9H7Z3 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NRDE2Q9H7Z3 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
NRDE2Q9H7Z3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NRDE2Q9H7Z3 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NRDE2Q9H7Z3 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NRDE2Q9H7Z3 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NRDE2Q9H7Z3 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NRDE2Q9H7Z3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NRDE2Q9H7Z3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NRDE2Q9H7Z3 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NRDE2Q9H7Z3 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NRDE2Q9H7Z3 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms