Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6I2

SOX17, Transcription factor SOX-17, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX17Q9H6I2 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SOX17Q9H6I2 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SOX17Q9H6I2 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SOX17Q9H6I2 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SOX17Q9H6I2 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SOX17Q9H6I2 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SOX17Q9H6I2 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SOX17Q9H6I2 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SOX17Q9H6I2 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SOX17Q9H6I2 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SOX17Q9H6I2 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SOX17Q9H6I2 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SOX17Q9H6I2 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SOX17Q9H6I2 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SOX17Q9H6I2 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SOX17Q9H6I2 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SOX17Q9H6I2 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SOX17Q9H6I2 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SOX17Q9H6I2 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SOX17Q9H6I2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SOX17Q9H6I2 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SOX17Q9H6I2 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SOX17Q9H6I2 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SOX17Q9H6I2 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SOX17Q9H6I2 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SOX17Q9H6I2 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SOX17Q9H6I2 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SOX17Q9H6I2 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SOX17Q9H6I2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SOX17Q9H6I2 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SOX17Q9H6I2 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SOX17Q9H6I2 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SOX17Q9H6I2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SOX17Q9H6I2 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SOX17Q9H6I2 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SOX17Q9H6I2 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SOX17Q9H6I2 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SOX17Q9H6I2 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SOX17Q9H6I2 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SOX17Q9H6I2 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SOX17Q9H6I2 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SOX17Q9H6I2 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SOX17Q9H6I2 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SOX17Q9H6I2 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SOX17Q9H6I2 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SOX17Q9H6I2 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SOX17Q9H6I2 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SOX17Q9H6I2 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SOX17Q9H6I2 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SOX17Q9H6I2 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SOX17Q9H6I2 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SOX17Q9H6I2 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SOX17Q9H6I2 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SOX17Q9H6I2 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SOX17Q9H6I2 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SOX17Q9H6I2 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SOX17Q9H6I2 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SOX17Q9H6I2 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SOX17Q9H6I2 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SOX17Q9H6I2 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SOX17Q9H6I2 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SOX17Q9H6I2 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SOX17Q9H6I2 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SOX17Q9H6I2 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SOX17Q9H6I2 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SOX17Q9H6I2 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SOX17Q9H6I2 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SOX17Q9H6I2 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SOX17Q9H6I2 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SOX17Q9H6I2 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SOX17Q9H6I2 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SOX17Q9H6I2 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SOX17Q9H6I2 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SOX17Q9H6I2 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SOX17Q9H6I2 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SOX17Q9H6I2 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SOX17Q9H6I2 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SOX17Q9H6I2 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SOX17Q9H6I2 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SOX17Q9H6I2 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SOX17Q9H6I2 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SOX17Q9H6I2 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SOX17Q9H6I2 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SOX17Q9H6I2 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SOX17Q9H6I2 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SOX17Q9H6I2 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SOX17Q9H6I2 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SOX17Q9H6I2 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SOX17Q9H6I2 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SOX17Q9H6I2 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SOX17Q9H6I2 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SOX17Q9H6I2 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SOX17Q9H6I2 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SOX17Q9H6I2 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SOX17Q9H6I2 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SOX17Q9H6I2 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SOX17Q9H6I2 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SOX17Q9H6I2 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SOX17Q9H6I2 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SOX17Q9H6I2 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms