Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2Z4

NKX2-4, Homeobox protein Nkx-2.4, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-4Q9H2Z4 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
NKX2-4Q9H2Z4 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NKX2-4Q9H2Z4 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NKX2-4Q9H2Z4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NKX2-4Q9H2Z4 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NKX2-4Q9H2Z4 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NKX2-4Q9H2Z4 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NKX2-4Q9H2Z4 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NKX2-4Q9H2Z4 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NKX2-4Q9H2Z4 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NKX2-4Q9H2Z4 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NKX2-4Q9H2Z4 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NKX2-4Q9H2Z4 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NKX2-4Q9H2Z4 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NKX2-4Q9H2Z4 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NKX2-4Q9H2Z4 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NKX2-4Q9H2Z4 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NKX2-4Q9H2Z4 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
NKX2-4Q9H2Z4 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NKX2-4Q9H2Z4 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NKX2-4Q9H2Z4 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NKX2-4Q9H2Z4 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NKX2-4Q9H2Z4 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NKX2-4Q9H2Z4 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NKX2-4Q9H2Z4 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NKX2-4Q9H2Z4 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NKX2-4Q9H2Z4 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NKX2-4Q9H2Z4 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NKX2-4Q9H2Z4 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NKX2-4Q9H2Z4 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NKX2-4Q9H2Z4 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NKX2-4Q9H2Z4 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
NKX2-4Q9H2Z4 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NKX2-4Q9H2Z4 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NKX2-4Q9H2Z4 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NKX2-4Q9H2Z4 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NKX2-4Q9H2Z4 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NKX2-4Q9H2Z4 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NKX2-4Q9H2Z4 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NKX2-4Q9H2Z4 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NKX2-4Q9H2Z4 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NKX2-4Q9H2Z4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NKX2-4Q9H2Z4 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NKX2-4Q9H2Z4 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NKX2-4Q9H2Z4 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NKX2-4Q9H2Z4 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NKX2-4Q9H2Z4 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NKX2-4Q9H2Z4 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NKX2-4Q9H2Z4 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NKX2-4Q9H2Z4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NKX2-4Q9H2Z4 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NKX2-4Q9H2Z4 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NKX2-4Q9H2Z4 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NKX2-4Q9H2Z4 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NKX2-4Q9H2Z4 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
NKX2-4Q9H2Z4 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NKX2-4Q9H2Z4 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
NKX2-4Q9H2Z4 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
NKX2-4Q9H2Z4 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
NKX2-4Q9H2Z4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NKX2-4Q9H2Z4 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NKX2-4Q9H2Z4 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NKX2-4Q9H2Z4 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NKX2-4Q9H2Z4 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NKX2-4Q9H2Z4 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NKX2-4Q9H2Z4 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NKX2-4Q9H2Z4 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
NKX2-4Q9H2Z4 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NKX2-4Q9H2Z4 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NKX2-4Q9H2Z4 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NKX2-4Q9H2Z4 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
NKX2-4Q9H2Z4 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NKX2-4Q9H2Z4 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
NKX2-4Q9H2Z4 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NKX2-4Q9H2Z4 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NKX2-4Q9H2Z4 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NKX2-4Q9H2Z4 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NKX2-4Q9H2Z4 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
NKX2-4Q9H2Z4 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NKX2-4Q9H2Z4 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
NKX2-4Q9H2Z4 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NKX2-4Q9H2Z4 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NKX2-4Q9H2Z4 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NKX2-4Q9H2Z4 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NKX2-4Q9H2Z4 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NKX2-4Q9H2Z4 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NKX2-4Q9H2Z4 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NKX2-4Q9H2Z4 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NKX2-4Q9H2Z4 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NKX2-4Q9H2Z4 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NKX2-4Q9H2Z4 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NKX2-4Q9H2Z4 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
NKX2-4Q9H2Z4 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NKX2-4Q9H2Z4 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NKX2-4Q9H2Z4 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NKX2-4Q9H2Z4 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NKX2-4Q9H2Z4 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
NKX2-4Q9H2Z4 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
NKX2-4Q9H2Z4 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NKX2-4Q9H2Z4 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms