Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2F9

CCDC68, Coiled-coil domain-containing protein 68, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC68Q9H2F9 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC68Q9H2F9 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC68Q9H2F9 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC68Q9H2F9 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC68Q9H2F9 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC68Q9H2F9 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC68Q9H2F9 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC68Q9H2F9 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC68Q9H2F9 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC68Q9H2F9 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC68Q9H2F9 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC68Q9H2F9 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC68Q9H2F9 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC68Q9H2F9 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC68Q9H2F9 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC68Q9H2F9 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC68Q9H2F9 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC68Q9H2F9 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC68Q9H2F9 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC68Q9H2F9 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC68Q9H2F9 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC68Q9H2F9 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC68Q9H2F9 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC68Q9H2F9 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC68Q9H2F9 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC68Q9H2F9 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC68Q9H2F9 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC68Q9H2F9 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC68Q9H2F9 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC68Q9H2F9 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC68Q9H2F9 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC68Q9H2F9 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC68Q9H2F9 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC68Q9H2F9 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC68Q9H2F9 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC68Q9H2F9 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC68Q9H2F9 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC68Q9H2F9 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC68Q9H2F9 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC68Q9H2F9 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC68Q9H2F9 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC68Q9H2F9 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC68Q9H2F9 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC68Q9H2F9 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC68Q9H2F9 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC68Q9H2F9 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC68Q9H2F9 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC68Q9H2F9 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC68Q9H2F9 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC68Q9H2F9 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC68Q9H2F9 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC68Q9H2F9 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC68Q9H2F9 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC68Q9H2F9 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC68Q9H2F9 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC68Q9H2F9 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC68Q9H2F9 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC68Q9H2F9 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC68Q9H2F9 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC68Q9H2F9 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC68Q9H2F9 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC68Q9H2F9 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC68Q9H2F9 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC68Q9H2F9 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC68Q9H2F9 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC68Q9H2F9 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC68Q9H2F9 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC68Q9H2F9 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC68Q9H2F9 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC68Q9H2F9 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC68Q9H2F9 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC68Q9H2F9 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC68Q9H2F9 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC68Q9H2F9 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC68Q9H2F9 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC68Q9H2F9 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC68Q9H2F9 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC68Q9H2F9 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC68Q9H2F9 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC68Q9H2F9 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC68Q9H2F9 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC68Q9H2F9 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC68Q9H2F9 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC68Q9H2F9 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC68Q9H2F9 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC68Q9H2F9 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC68Q9H2F9 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC68Q9H2F9 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC68Q9H2F9 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC68Q9H2F9 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC68Q9H2F9 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC68Q9H2F9 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC68Q9H2F9 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC68Q9H2F9 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC68Q9H2F9 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC68Q9H2F9 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC68Q9H2F9 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC68Q9H2F9 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC68Q9H2F9 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC68Q9H2F9 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms