Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0L4

CSTF2T, Cleavage stimulation factor subunit 2 tau variant, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF2TQ9H0L4 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.92e-8■■■■□ 26.4
CSTF2TQ9H0L4 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.882e-8■■■■□ 26.4
CSTF2TQ9H0L4 FAM222B-206ENST00000579381 462 ntTSL 520.57■□□□□ 0.882e-8■■■■□ 26.4
CSTF2TQ9H0L4 RGS20-208ENST00000523064 610 ntTSL 1 (best)20.04■□□□□ 0.81e-7■■■■□ 26.4
CSTF2TQ9H0L4 FAM222B-207ENST00000581229 598 ntTSL 419.43■□□□□ 0.72e-8■■■■□ 26.4
CSTF2TQ9H0L4 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.676e-8■■■■□ 26.4
CSTF2TQ9H0L4 PTMS-203ENST00000538057 976 ntTSL 218.71■□□□□ 0.593e-12■■■■□ 26.4
CSTF2TQ9H0L4 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.426e-8■■■■□ 26.4
CSTF2TQ9H0L4 TTLL3-210ENST00000427220 3233 ntTSL 1 (best)17.61■□□□□ 0.416e-8■■■■□ 26.4
CSTF2TQ9H0L4 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.086e-8■■■■□ 26.4
CSTF2TQ9H0L4 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.062e-8■■■■□ 26.4
CSTF2TQ9H0L4 EEFSEC-204ENST00000484438 640 ntTSL 315.17■□□□□ 0.026e-8■■■■□ 26.4
CSTF2TQ9H0L4 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.021e-7■■■■□ 26.4
CSTF2TQ9H0L4 PROX1-AS1-222ENST00000625209 389 ntTSL 514.32□□□□□ -0.126e-8■■■■□ 26.4
CSTF2TQ9H0L4 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.196e-8■■■■□ 26.4
CSTF2TQ9H0L4 PROX1-AS1-227ENST00000626228 743 ntTSL 513.83□□□□□ -0.26e-8■■■■□ 26.4
CSTF2TQ9H0L4 PROX1-AS1-242ENST00000630180 954 ntTSL 512.82□□□□□ -0.366e-8■■■■□ 26.4
CSTF2TQ9H0L4 TTLL3-212ENST00000430718 536 ntTSL 412.76□□□□□ -0.376e-8■■■■□ 26.4
CSTF2TQ9H0L4 TTLL3-203ENST00000414814 549 ntTSL 512.76□□□□□ -0.376e-8■■■■□ 26.4
CSTF2TQ9H0L4 PROX1-AS1-235ENST00000628896 711 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.396e-8■■■■□ 26.4
CSTF2TQ9H0L4 TTLL3-205ENST00000418745 540 ntTSL 412.28□□□□□ -0.446e-8■■■■□ 26.4
CSTF2TQ9H0L4 NBEAP3-201ENST00000420638 1493 ntBASIC11.67□□□□□ -0.545e-15■■■■□ 26.4
CSTF2TQ9H0L4 FAM222B-209ENST00000581407 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.552e-8■■■■□ 26.4
CSTF2TQ9H0L4 TTLL3-206ENST00000419081 591 ntTSL 511.11□□□□□ -0.636e-8■■■■□ 26.4
CSTF2TQ9H0L4 ARPC4-TTLL3-203ENST00000424442 903 ntTSL 510.59□□□□□ -0.716e-8■■■■□ 26.4
CSTF2TQ9H0L4 TTLL3-204ENST00000417065 565 ntTSL 410.59□□□□□ -0.716e-8■■■■□ 26.4
CSTF2TQ9H0L4 TTLL3-222ENST00000459758 555 ntTSL 410.59□□□□□ -0.716e-8■■■■□ 26.4
CSTF2TQ9H0L4 TTLL3-219ENST00000452597 603 ntTSL 410.59□□□□□ -0.716e-8■■■■□ 26.4
CSTF2TQ9H0L4 PROX1-AS1-245ENST00000630538 921 ntTSL 510.37□□□□□ -0.756e-8■■■■□ 26.4
CSTF2TQ9H0L4 ARPC4-TTLL3-202ENST00000418163 551 ntTSL 410.14□□□□□ -0.796e-8■■■■□ 26.4
CSTF2TQ9H0L4 PROX1-AS1-229ENST00000626670 759 ntTSL 510.05□□□□□ -0.86e-8■■■■□ 26.4
CSTF2TQ9H0L4 PROX1-AS1-239ENST00000629743 695 ntTSL 510.05□□□□□ -0.86e-8■■■■□ 26.4
CSTF2TQ9H0L4 FAM222B-212ENST00000583307 886 ntTSL 210.03□□□□□ -0.82e-8■■■■□ 26.4
CSTF2TQ9H0L4 PROX1-AS1-225ENST00000625722 830 ntTSL 59.5□□□□□ -0.896e-8■■■■□ 26.4
CSTF2TQ9H0L4 PROX1-AS1-205ENST00000598091 720 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.916e-8■■■■□ 26.4
CSTF2TQ9H0L4 PROX1-AS1-240ENST00000630095 314 ntTSL 59.16□□□□□ -0.946e-8■■■■□ 26.4
CSTF2TQ9H0L4 FAM222B-204ENST00000577513 731 ntTSL 39.12□□□□□ -0.952e-8■■■■□ 26.4
CSTF2TQ9H0L4 PROX1-AS1-216ENST00000608936 900 ntTSL 59.08□□□□□ -0.966e-8■■■■□ 26.4
CSTF2TQ9H0L4 TTLL3-217ENST00000439814 497 ntTSL 48.93□□□□□ -0.986e-8■■■■□ 26.4
CSTF2TQ9H0L4 PROX1-AS1-241ENST00000630124 649 ntTSL 58.92□□□□□ -0.986e-8■■■■□ 26.4
CSTF2TQ9H0L4 PROX1-AS1-236ENST00000628999 634 ntTSL 58.9□□□□□ -0.986e-8■■■■□ 26.4
CSTF2TQ9H0L4 PROX1-AS1-223ENST00000625344 365 ntTSL 58.58□□□□□ -1.046e-8■■■■□ 26.4
CSTF2TQ9H0L4 FAM222B-214ENST00000583953 564 ntTSL 4 BASIC8.33□□□□□ -1.082e-8■■■■□ 26.4
CSTF2TQ9H0L4 PROX1-AS1-233ENST00000627855 520 ntTSL 58.13□□□□□ -1.116e-8■■■■□ 26.4
CSTF2TQ9H0L4 PROX1-AS1-221ENST00000615085 673 ntTSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.136e-8■■■■□ 26.4
CSTF2TQ9H0L4 PROX1-AS1-234ENST00000628143 324 ntTSL 57.95□□□□□ -1.146e-8■■■■□ 26.4
CSTF2TQ9H0L4 RGS20-207ENST00000522225 1559 ntTSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.151e-7■■■■□ 26.4
CSTF2TQ9H0L4 PROX1-AS1-226ENST00000626034 310 ntTSL 57.78□□□□□ -1.166e-8■■■■□ 26.4
CSTF2TQ9H0L4 PROX1-AS1-243ENST00000630223 710 ntTSL 57.77□□□□□ -1.176e-8■■■■□ 26.4
CSTF2TQ9H0L4 PROX1-AS1-203ENST00000451396 476 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.186e-8■■■■□ 26.4
CSTF2TQ9H0L4 PROX1-AS1-202ENST00000433082 5266 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.276e-8■■■■□ 26.4
CSTF2TQ9H0L4 TTLL3-216ENST00000438596 540 ntTSL 57.12□□□□□ -1.276e-8■■■■□ 26.4
CSTF2TQ9H0L4 PROX1-AS1-228ENST00000626372 504 ntTSL 56.95□□□□□ -1.36e-8■■■■□ 26.4
CSTF2TQ9H0L4 ARPC4-TTLL3-204ENST00000453882 499 ntTSL 46.55□□□□□ -1.366e-8■■■■□ 26.4
CSTF2TQ9H0L4 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.22■□□□□ 0.991e-8■■■■□ 26.4
CSTF2TQ9H0L4 USF2-206ENST00000594264 2742 ntTSL 213.64□□□□□ -0.231e-6■■■■□ 26.4
CSTF2TQ9H0L4 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.929e-7■■■■□ 26.4
CSTF2TQ9H0L4 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.71e-6■■■■□ 26.4
CSTF2TQ9H0L4 SLC19A1-204ENST00000427839 648 ntTSL 316.59■□□□□ 0.259e-7■■■■□ 26.4
CSTF2TQ9H0L4 SLC19A1-205ENST00000443742 777 ntTSL 314.62□□□□□ -0.079e-7■■■■□ 26.4
CSTF2TQ9H0L4 IGF2BP3-213ENST00000491719 800 ntTSL 519.45■□□□□ 0.74e-7■■■■□ 26.3
CSTF2TQ9H0L4 IGF2BP3-202ENST00000421467 2988 ntTSL 510.02□□□□□ -0.814e-7■■■■□ 26.3
CSTF2TQ9H0L4 IGF2BP3-201ENST00000258729 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.44e-7■■■■□ 26.3
CSTF2TQ9H0L4 RGS12-205ENST00000502947 2237 ntTSL 1 (best)18.38■□□□□ 0.532e-7■■■■□ 26.3
CSTF2TQ9H0L4 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.14e-7■■■■□ 26.3
CSTF2TQ9H0L4 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.184e-7■■■■□ 26.3
CSTF2TQ9H0L4 ZNF655-204ENST00000394163 4528 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.64e-7■■■■□ 26.3
CSTF2TQ9H0L4 ZNF655-207ENST00000419215 4346 ntTSL 1 (best)7.3□□□□□ -1.244e-7■■■■□ 26.3
CSTF2TQ9H0L4 ZBTB34-201ENST00000319119 6564 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.757e-7■■■■□ 26.3
CSTF2TQ9H0L4 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.641e-7■■■■□ 26.3
CSTF2TQ9H0L4 ZNF580-205ENST00000592461 377 ntTSL 318.93■□□□□ 0.629e-9■■■■□ 26.3
CSTF2TQ9H0L4 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.122e-6■■■■□ 26.3
CSTF2TQ9H0L4 SERINC2-204ENST00000491976 2807 ntTSL 215.15■□□□□ 0.022e-6■■■■□ 26.3
CSTF2TQ9H0L4 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.433e-7■■■■□ 26.3
CSTF2TQ9H0L4 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.259e-7■■■■□ 26.3
CSTF2TQ9H0L4 ELL-202ENST00000594635 4074 ntTSL 1 (best)12.71□□□□□ -0.379e-7■■■■□ 26.3
CSTF2TQ9H0L4 TSPAN4-217ENST00000527644 968 ntTSL 224.69■■□□□ 1.543e-7■■■■□ 26.3
CSTF2TQ9H0L4 PRKAR1B-206ENST00000417852 651 ntTSL 217.75■□□□□ 0.437e-7■■■■□ 26.3
CSTF2TQ9H0L4 RPH3AL-216ENST00000575130 579 ntTSL 415.68■□□□□ 0.15e-7■■■■□ 26.3
CSTF2TQ9H0L4 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.184e-8■■■■□ 26.3
CSTF2TQ9H0L4 KDM5B-203ENST00000367265 10345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.534e-8■■■■□ 26.3
CSTF2TQ9H0L4 KDM5B-210ENST00000602511 542 ntTSL 57.4□□□□□ -1.224e-8■■■■□ 26.3
CSTF2TQ9H0L4 DAPK1-204ENST00000466188 1064 ntTSL 39.7□□□□□ -0.867e-8■■■■□ 26.3
CSTF2TQ9H0L4 DAPK1-214ENST00000494010 696 ntTSL 35.07□□□□□ -1.67e-8■■■■□ 26.3
CSTF2TQ9H0L4 WFS1-206ENST00000513395 570 ntTSL 216.76■□□□□ 0.271e-6■■■■□ 26.3
CSTF2TQ9H0L4 CHST15-202ENST00000435907 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.569e-7■■■■□ 26.3
CSTF2TQ9H0L4 CHST15-203ENST00000462406 826 ntTSL 27.47□□□□□ -1.219e-7■■■■□ 26.3
CSTF2TQ9H0L4 GPX4-202ENST00000585362 859 ntTSL 224.61■■□□□ 1.538e-8■■■■□ 26.3
CSTF2TQ9H0L4 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.342e-7■■■■□ 26.3
CSTF2TQ9H0L4 AKT1-212ENST00000555380 534 ntTSL 410.66□□□□□ -0.76e-8■■■■□ 26.2
CSTF2TQ9H0L4 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.294e-8■■■■□ 26.2
CSTF2TQ9H0L4 TAB2-208ENST00000636456 3092 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.244e-8■■■■□ 26.2
CSTF2TQ9H0L4 TAB2-206ENST00000606202 648 ntTSL 46.66□□□□□ -1.344e-8■■■■□ 26.2
CSTF2TQ9H0L4 STAU2-222ENST00000522962 1041 ntTSL 36.86□□□□□ -1.311e-7■■■■□ 26.2
CSTF2TQ9H0L4 MAEA-204ENST00000503162 2069 ntTSL 215.34■□□□□ 0.053e-7■■■■□ 26.2
CSTF2TQ9H0L4 MAEA-220ENST00000515766 3136 ntTSL 214.94□□□□□ -0.023e-7■■■■□ 26.2
CSTF2TQ9H0L4 UGCG-203ENST00000489355 526 ntTSL 217.07■□□□□ 0.322e-7■■■■□ 26.2
CSTF2TQ9H0L4 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.032e-7■■■■□ 26.2
CSTF2TQ9H0L4 UGCG-204ENST00000490110 581 ntTSL 39.26□□□□□ -0.932e-7■■■■□ 26.2
CSTF2TQ9H0L4 UGCG-205ENST00000495085 772 ntTSL 36.25□□□□□ -1.412e-7■■■■□ 26.2
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