Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0E7

USP44, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 44, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP44Q9H0E7 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
USP44Q9H0E7 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
USP44Q9H0E7 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
USP44Q9H0E7 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
USP44Q9H0E7 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
USP44Q9H0E7 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
USP44Q9H0E7 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
USP44Q9H0E7 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
USP44Q9H0E7 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
USP44Q9H0E7 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
USP44Q9H0E7 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
USP44Q9H0E7 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
USP44Q9H0E7 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
USP44Q9H0E7 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
USP44Q9H0E7 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
USP44Q9H0E7 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
USP44Q9H0E7 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
USP44Q9H0E7 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
USP44Q9H0E7 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
USP44Q9H0E7 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
USP44Q9H0E7 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
USP44Q9H0E7 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
USP44Q9H0E7 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
USP44Q9H0E7 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
USP44Q9H0E7 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
USP44Q9H0E7 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
USP44Q9H0E7 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
USP44Q9H0E7 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
USP44Q9H0E7 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
USP44Q9H0E7 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
USP44Q9H0E7 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
USP44Q9H0E7 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
USP44Q9H0E7 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
USP44Q9H0E7 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
USP44Q9H0E7 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
USP44Q9H0E7 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
USP44Q9H0E7 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
USP44Q9H0E7 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
USP44Q9H0E7 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
USP44Q9H0E7 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
USP44Q9H0E7 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
USP44Q9H0E7 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
USP44Q9H0E7 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
USP44Q9H0E7 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
USP44Q9H0E7 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
USP44Q9H0E7 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
USP44Q9H0E7 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
USP44Q9H0E7 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
USP44Q9H0E7 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
USP44Q9H0E7 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
USP44Q9H0E7 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
USP44Q9H0E7 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
USP44Q9H0E7 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
USP44Q9H0E7 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
USP44Q9H0E7 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
USP44Q9H0E7 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
USP44Q9H0E7 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
USP44Q9H0E7 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
USP44Q9H0E7 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
USP44Q9H0E7 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
USP44Q9H0E7 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
USP44Q9H0E7 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
USP44Q9H0E7 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
USP44Q9H0E7 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
USP44Q9H0E7 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
USP44Q9H0E7 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
USP44Q9H0E7 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
USP44Q9H0E7 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
USP44Q9H0E7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
USP44Q9H0E7 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
USP44Q9H0E7 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
USP44Q9H0E7 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
USP44Q9H0E7 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
USP44Q9H0E7 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
USP44Q9H0E7 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
USP44Q9H0E7 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
USP44Q9H0E7 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
USP44Q9H0E7 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
USP44Q9H0E7 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
USP44Q9H0E7 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
USP44Q9H0E7 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
USP44Q9H0E7 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
USP44Q9H0E7 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
USP44Q9H0E7 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
USP44Q9H0E7 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
USP44Q9H0E7 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
USP44Q9H0E7 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
USP44Q9H0E7 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
USP44Q9H0E7 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
USP44Q9H0E7 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
USP44Q9H0E7 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
USP44Q9H0E7 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
USP44Q9H0E7 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
USP44Q9H0E7 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
USP44Q9H0E7 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
USP44Q9H0E7 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
USP44Q9H0E7 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
USP44Q9H0E7 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
USP44Q9H0E7 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
USP44Q9H0E7 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms