Protein–RNA interactions for Protein: Q9H094

NBPF3, Neuroblastoma breakpoint family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF3Q9H094 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NBPF3Q9H094 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NBPF3Q9H094 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NBPF3Q9H094 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NBPF3Q9H094 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NBPF3Q9H094 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NBPF3Q9H094 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NBPF3Q9H094 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NBPF3Q9H094 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NBPF3Q9H094 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NBPF3Q9H094 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NBPF3Q9H094 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NBPF3Q9H094 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NBPF3Q9H094 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NBPF3Q9H094 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NBPF3Q9H094 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
NBPF3Q9H094 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NBPF3Q9H094 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
NBPF3Q9H094 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NBPF3Q9H094 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NBPF3Q9H094 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NBPF3Q9H094 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NBPF3Q9H094 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NBPF3Q9H094 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NBPF3Q9H094 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NBPF3Q9H094 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
NBPF3Q9H094 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
NBPF3Q9H094 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
NBPF3Q9H094 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NBPF3Q9H094 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NBPF3Q9H094 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NBPF3Q9H094 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NBPF3Q9H094 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NBPF3Q9H094 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NBPF3Q9H094 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NBPF3Q9H094 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NBPF3Q9H094 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NBPF3Q9H094 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NBPF3Q9H094 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NBPF3Q9H094 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NBPF3Q9H094 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NBPF3Q9H094 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NBPF3Q9H094 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NBPF3Q9H094 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NBPF3Q9H094 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NBPF3Q9H094 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NBPF3Q9H094 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NBPF3Q9H094 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NBPF3Q9H094 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NBPF3Q9H094 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NBPF3Q9H094 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NBPF3Q9H094 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NBPF3Q9H094 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NBPF3Q9H094 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NBPF3Q9H094 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NBPF3Q9H094 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NBPF3Q9H094 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
NBPF3Q9H094 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NBPF3Q9H094 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NBPF3Q9H094 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NBPF3Q9H094 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NBPF3Q9H094 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NBPF3Q9H094 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NBPF3Q9H094 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NBPF3Q9H094 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
NBPF3Q9H094 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NBPF3Q9H094 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NBPF3Q9H094 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NBPF3Q9H094 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NBPF3Q9H094 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NBPF3Q9H094 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NBPF3Q9H094 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NBPF3Q9H094 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NBPF3Q9H094 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NBPF3Q9H094 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NBPF3Q9H094 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NBPF3Q9H094 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NBPF3Q9H094 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NBPF3Q9H094 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
NBPF3Q9H094 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NBPF3Q9H094 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NBPF3Q9H094 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NBPF3Q9H094 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NBPF3Q9H094 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NBPF3Q9H094 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NBPF3Q9H094 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NBPF3Q9H094 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NBPF3Q9H094 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NBPF3Q9H094 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NBPF3Q9H094 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NBPF3Q9H094 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NBPF3Q9H094 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NBPF3Q9H094 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NBPF3Q9H094 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NBPF3Q9H094 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NBPF3Q9H094 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NBPF3Q9H094 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NBPF3Q9H094 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NBPF3Q9H094 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NBPF3Q9H094 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 177.5 ms