Protein–RNA interactions for Protein: Q9H000

MKRN2, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN2Q9H000 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MKRN2Q9H000 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MKRN2Q9H000 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
MKRN2Q9H000 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MKRN2Q9H000 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MKRN2Q9H000 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MKRN2Q9H000 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MKRN2Q9H000 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MKRN2Q9H000 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MKRN2Q9H000 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MKRN2Q9H000 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MKRN2Q9H000 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MKRN2Q9H000 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MKRN2Q9H000 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
MKRN2Q9H000 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MKRN2Q9H000 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MKRN2Q9H000 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MKRN2Q9H000 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
MKRN2Q9H000 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MKRN2Q9H000 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MKRN2Q9H000 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
MKRN2Q9H000 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MKRN2Q9H000 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MKRN2Q9H000 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MKRN2Q9H000 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MKRN2Q9H000 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MKRN2Q9H000 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MKRN2Q9H000 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MKRN2Q9H000 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MKRN2Q9H000 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MKRN2Q9H000 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MKRN2Q9H000 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MKRN2Q9H000 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MKRN2Q9H000 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MKRN2Q9H000 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MKRN2Q9H000 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MKRN2Q9H000 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MKRN2Q9H000 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MKRN2Q9H000 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MKRN2Q9H000 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MKRN2Q9H000 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MKRN2Q9H000 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MKRN2Q9H000 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MKRN2Q9H000 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MKRN2Q9H000 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MKRN2Q9H000 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MKRN2Q9H000 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MKRN2Q9H000 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MKRN2Q9H000 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MKRN2Q9H000 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MKRN2Q9H000 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MKRN2Q9H000 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MKRN2Q9H000 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MKRN2Q9H000 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MKRN2Q9H000 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
MKRN2Q9H000 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MKRN2Q9H000 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
MKRN2Q9H000 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MKRN2Q9H000 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MKRN2Q9H000 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MKRN2Q9H000 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MKRN2Q9H000 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MKRN2Q9H000 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MKRN2Q9H000 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MKRN2Q9H000 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MKRN2Q9H000 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MKRN2Q9H000 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MKRN2Q9H000 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MKRN2Q9H000 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MKRN2Q9H000 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MKRN2Q9H000 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MKRN2Q9H000 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MKRN2Q9H000 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MKRN2Q9H000 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MKRN2Q9H000 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MKRN2Q9H000 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MKRN2Q9H000 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MKRN2Q9H000 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MKRN2Q9H000 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MKRN2Q9H000 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MKRN2Q9H000 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MKRN2Q9H000 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MKRN2Q9H000 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MKRN2Q9H000 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
MKRN2Q9H000 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MKRN2Q9H000 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MKRN2Q9H000 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MKRN2Q9H000 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MKRN2Q9H000 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MKRN2Q9H000 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MKRN2Q9H000 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MKRN2Q9H000 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MKRN2Q9H000 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MKRN2Q9H000 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MKRN2Q9H000 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MKRN2Q9H000 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MKRN2Q9H000 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MKRN2Q9H000 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MKRN2Q9H000 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MKRN2Q9H000 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms