Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM5

YIPF3, Protein YIPF3, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YIPF3Q9GZM5 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
YIPF3Q9GZM5 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
YIPF3Q9GZM5 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
YIPF3Q9GZM5 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
YIPF3Q9GZM5 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
YIPF3Q9GZM5 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
YIPF3Q9GZM5 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
YIPF3Q9GZM5 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
YIPF3Q9GZM5 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
YIPF3Q9GZM5 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
YIPF3Q9GZM5 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
YIPF3Q9GZM5 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
YIPF3Q9GZM5 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
YIPF3Q9GZM5 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
YIPF3Q9GZM5 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
YIPF3Q9GZM5 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
YIPF3Q9GZM5 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
YIPF3Q9GZM5 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
YIPF3Q9GZM5 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
YIPF3Q9GZM5 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
YIPF3Q9GZM5 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
YIPF3Q9GZM5 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
YIPF3Q9GZM5 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
YIPF3Q9GZM5 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
YIPF3Q9GZM5 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
YIPF3Q9GZM5 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
YIPF3Q9GZM5 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
YIPF3Q9GZM5 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
YIPF3Q9GZM5 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
YIPF3Q9GZM5 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
YIPF3Q9GZM5 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
YIPF3Q9GZM5 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
YIPF3Q9GZM5 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
YIPF3Q9GZM5 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
YIPF3Q9GZM5 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
YIPF3Q9GZM5 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
YIPF3Q9GZM5 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
YIPF3Q9GZM5 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
YIPF3Q9GZM5 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
YIPF3Q9GZM5 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
YIPF3Q9GZM5 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
YIPF3Q9GZM5 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
YIPF3Q9GZM5 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
YIPF3Q9GZM5 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
YIPF3Q9GZM5 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
YIPF3Q9GZM5 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
YIPF3Q9GZM5 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
YIPF3Q9GZM5 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
YIPF3Q9GZM5 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
YIPF3Q9GZM5 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
YIPF3Q9GZM5 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
YIPF3Q9GZM5 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
YIPF3Q9GZM5 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
YIPF3Q9GZM5 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
YIPF3Q9GZM5 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
YIPF3Q9GZM5 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
YIPF3Q9GZM5 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
YIPF3Q9GZM5 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
YIPF3Q9GZM5 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
YIPF3Q9GZM5 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
YIPF3Q9GZM5 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
YIPF3Q9GZM5 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
YIPF3Q9GZM5 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
YIPF3Q9GZM5 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
YIPF3Q9GZM5 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
YIPF3Q9GZM5 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
YIPF3Q9GZM5 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
YIPF3Q9GZM5 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
YIPF3Q9GZM5 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
YIPF3Q9GZM5 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
YIPF3Q9GZM5 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
YIPF3Q9GZM5 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
YIPF3Q9GZM5 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
YIPF3Q9GZM5 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
YIPF3Q9GZM5 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
YIPF3Q9GZM5 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
YIPF3Q9GZM5 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
YIPF3Q9GZM5 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
YIPF3Q9GZM5 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
YIPF3Q9GZM5 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
YIPF3Q9GZM5 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
YIPF3Q9GZM5 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
YIPF3Q9GZM5 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
YIPF3Q9GZM5 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
YIPF3Q9GZM5 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
YIPF3Q9GZM5 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
YIPF3Q9GZM5 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
YIPF3Q9GZM5 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
YIPF3Q9GZM5 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
YIPF3Q9GZM5 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
YIPF3Q9GZM5 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
YIPF3Q9GZM5 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
YIPF3Q9GZM5 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
YIPF3Q9GZM5 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
YIPF3Q9GZM5 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
YIPF3Q9GZM5 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
YIPF3Q9GZM5 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
YIPF3Q9GZM5 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
YIPF3Q9GZM5 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
YIPF3Q9GZM5 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms