Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C9

UBE2O, (E3-independent) E2 ubiquitin-conjugating enzyme, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2OQ9C0C9 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
UBE2OQ9C0C9 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBE2OQ9C0C9 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBE2OQ9C0C9 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBE2OQ9C0C9 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBE2OQ9C0C9 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
UBE2OQ9C0C9 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
UBE2OQ9C0C9 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
UBE2OQ9C0C9 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
UBE2OQ9C0C9 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
UBE2OQ9C0C9 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
UBE2OQ9C0C9 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
UBE2OQ9C0C9 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
UBE2OQ9C0C9 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
UBE2OQ9C0C9 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
UBE2OQ9C0C9 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
UBE2OQ9C0C9 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
UBE2OQ9C0C9 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
UBE2OQ9C0C9 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
UBE2OQ9C0C9 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
UBE2OQ9C0C9 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
UBE2OQ9C0C9 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
UBE2OQ9C0C9 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
UBE2OQ9C0C9 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
UBE2OQ9C0C9 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
UBE2OQ9C0C9 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
UBE2OQ9C0C9 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
UBE2OQ9C0C9 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
UBE2OQ9C0C9 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
UBE2OQ9C0C9 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
UBE2OQ9C0C9 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
UBE2OQ9C0C9 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
UBE2OQ9C0C9 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
UBE2OQ9C0C9 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
UBE2OQ9C0C9 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
UBE2OQ9C0C9 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
UBE2OQ9C0C9 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
UBE2OQ9C0C9 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
UBE2OQ9C0C9 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
UBE2OQ9C0C9 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
UBE2OQ9C0C9 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
UBE2OQ9C0C9 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBE2OQ9C0C9 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBE2OQ9C0C9 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
UBE2OQ9C0C9 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBE2OQ9C0C9 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBE2OQ9C0C9 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBE2OQ9C0C9 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBE2OQ9C0C9 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBE2OQ9C0C9 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBE2OQ9C0C9 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBE2OQ9C0C9 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBE2OQ9C0C9 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBE2OQ9C0C9 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
UBE2OQ9C0C9 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBE2OQ9C0C9 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBE2OQ9C0C9 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBE2OQ9C0C9 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBE2OQ9C0C9 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBE2OQ9C0C9 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBE2OQ9C0C9 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
UBE2OQ9C0C9 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
UBE2OQ9C0C9 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
UBE2OQ9C0C9 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
UBE2OQ9C0C9 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
UBE2OQ9C0C9 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
UBE2OQ9C0C9 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
UBE2OQ9C0C9 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
UBE2OQ9C0C9 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
UBE2OQ9C0C9 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
UBE2OQ9C0C9 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
UBE2OQ9C0C9 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
UBE2OQ9C0C9 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
UBE2OQ9C0C9 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
UBE2OQ9C0C9 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
UBE2OQ9C0C9 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
UBE2OQ9C0C9 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
UBE2OQ9C0C9 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
UBE2OQ9C0C9 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
UBE2OQ9C0C9 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
UBE2OQ9C0C9 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
UBE2OQ9C0C9 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
UBE2OQ9C0C9 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
UBE2OQ9C0C9 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBE2OQ9C0C9 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBE2OQ9C0C9 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBE2OQ9C0C9 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBE2OQ9C0C9 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBE2OQ9C0C9 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBE2OQ9C0C9 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBE2OQ9C0C9 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBE2OQ9C0C9 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBE2OQ9C0C9 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
UBE2OQ9C0C9 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
UBE2OQ9C0C9 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
UBE2OQ9C0C9 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
UBE2OQ9C0C9 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
UBE2OQ9C0C9 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
UBE2OQ9C0C9 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
UBE2OQ9C0C9 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms