Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C7

AMBRA1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMBRA1Q9C0C7 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AMBRA1Q9C0C7 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
AMBRA1Q9C0C7 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AMBRA1Q9C0C7 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
AMBRA1Q9C0C7 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AMBRA1Q9C0C7 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AMBRA1Q9C0C7 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AMBRA1Q9C0C7 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AMBRA1Q9C0C7 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AMBRA1Q9C0C7 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AMBRA1Q9C0C7 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AMBRA1Q9C0C7 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AMBRA1Q9C0C7 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
AMBRA1Q9C0C7 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
AMBRA1Q9C0C7 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AMBRA1Q9C0C7 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
AMBRA1Q9C0C7 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AMBRA1Q9C0C7 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
AMBRA1Q9C0C7 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
AMBRA1Q9C0C7 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AMBRA1Q9C0C7 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AMBRA1Q9C0C7 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
AMBRA1Q9C0C7 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
AMBRA1Q9C0C7 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AMBRA1Q9C0C7 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AMBRA1Q9C0C7 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AMBRA1Q9C0C7 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AMBRA1Q9C0C7 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AMBRA1Q9C0C7 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
AMBRA1Q9C0C7 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AMBRA1Q9C0C7 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
AMBRA1Q9C0C7 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AMBRA1Q9C0C7 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AMBRA1Q9C0C7 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
AMBRA1Q9C0C7 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AMBRA1Q9C0C7 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AMBRA1Q9C0C7 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
AMBRA1Q9C0C7 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
AMBRA1Q9C0C7 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
AMBRA1Q9C0C7 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
AMBRA1Q9C0C7 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AMBRA1Q9C0C7 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
AMBRA1Q9C0C7 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AMBRA1Q9C0C7 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AMBRA1Q9C0C7 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
AMBRA1Q9C0C7 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
AMBRA1Q9C0C7 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AMBRA1Q9C0C7 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
AMBRA1Q9C0C7 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
AMBRA1Q9C0C7 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
AMBRA1Q9C0C7 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AMBRA1Q9C0C7 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AMBRA1Q9C0C7 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AMBRA1Q9C0C7 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AMBRA1Q9C0C7 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AMBRA1Q9C0C7 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AMBRA1Q9C0C7 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AMBRA1Q9C0C7 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AMBRA1Q9C0C7 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
AMBRA1Q9C0C7 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AMBRA1Q9C0C7 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AMBRA1Q9C0C7 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AMBRA1Q9C0C7 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AMBRA1Q9C0C7 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AMBRA1Q9C0C7 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AMBRA1Q9C0C7 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AMBRA1Q9C0C7 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AMBRA1Q9C0C7 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AMBRA1Q9C0C7 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AMBRA1Q9C0C7 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
AMBRA1Q9C0C7 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AMBRA1Q9C0C7 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AMBRA1Q9C0C7 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AMBRA1Q9C0C7 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AMBRA1Q9C0C7 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AMBRA1Q9C0C7 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
AMBRA1Q9C0C7 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AMBRA1Q9C0C7 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
AMBRA1Q9C0C7 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
AMBRA1Q9C0C7 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
AMBRA1Q9C0C7 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
AMBRA1Q9C0C7 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AMBRA1Q9C0C7 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AMBRA1Q9C0C7 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
AMBRA1Q9C0C7 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AMBRA1Q9C0C7 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AMBRA1Q9C0C7 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AMBRA1Q9C0C7 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AMBRA1Q9C0C7 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AMBRA1Q9C0C7 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AMBRA1Q9C0C7 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AMBRA1Q9C0C7 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AMBRA1Q9C0C7 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
AMBRA1Q9C0C7 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AMBRA1Q9C0C7 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AMBRA1Q9C0C7 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AMBRA1Q9C0C7 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AMBRA1Q9C0C7 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AMBRA1Q9C0C7 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AMBRA1Q9C0C7 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130.4 ms