Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZX4

ROPN1B, Ropporin-1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1BQ9BZX4 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ROPN1BQ9BZX4 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ROPN1BQ9BZX4 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ROPN1BQ9BZX4 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ROPN1BQ9BZX4 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ROPN1BQ9BZX4 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ROPN1BQ9BZX4 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ROPN1BQ9BZX4 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ROPN1BQ9BZX4 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ROPN1BQ9BZX4 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ROPN1BQ9BZX4 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ROPN1BQ9BZX4 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ROPN1BQ9BZX4 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ROPN1BQ9BZX4 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ROPN1BQ9BZX4 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ROPN1BQ9BZX4 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ROPN1BQ9BZX4 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ROPN1BQ9BZX4 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ROPN1BQ9BZX4 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ROPN1BQ9BZX4 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ROPN1BQ9BZX4 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ROPN1BQ9BZX4 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ROPN1BQ9BZX4 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ROPN1BQ9BZX4 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ROPN1BQ9BZX4 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ROPN1BQ9BZX4 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ROPN1BQ9BZX4 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ROPN1BQ9BZX4 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ROPN1BQ9BZX4 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ROPN1BQ9BZX4 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ROPN1BQ9BZX4 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ROPN1BQ9BZX4 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ROPN1BQ9BZX4 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ROPN1BQ9BZX4 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ROPN1BQ9BZX4 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ROPN1BQ9BZX4 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ROPN1BQ9BZX4 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ROPN1BQ9BZX4 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ROPN1BQ9BZX4 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ROPN1BQ9BZX4 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ROPN1BQ9BZX4 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ROPN1BQ9BZX4 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ROPN1BQ9BZX4 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ROPN1BQ9BZX4 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ROPN1BQ9BZX4 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ROPN1BQ9BZX4 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ROPN1BQ9BZX4 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ROPN1BQ9BZX4 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ROPN1BQ9BZX4 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ROPN1BQ9BZX4 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ROPN1BQ9BZX4 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ROPN1BQ9BZX4 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ROPN1BQ9BZX4 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ROPN1BQ9BZX4 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ROPN1BQ9BZX4 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ROPN1BQ9BZX4 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ROPN1BQ9BZX4 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ROPN1BQ9BZX4 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ROPN1BQ9BZX4 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ROPN1BQ9BZX4 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ROPN1BQ9BZX4 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ROPN1BQ9BZX4 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ROPN1BQ9BZX4 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ROPN1BQ9BZX4 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ROPN1BQ9BZX4 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ROPN1BQ9BZX4 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ROPN1BQ9BZX4 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ROPN1BQ9BZX4 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ROPN1BQ9BZX4 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ROPN1BQ9BZX4 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ROPN1BQ9BZX4 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ROPN1BQ9BZX4 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ROPN1BQ9BZX4 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ROPN1BQ9BZX4 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ROPN1BQ9BZX4 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ROPN1BQ9BZX4 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ROPN1BQ9BZX4 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ROPN1BQ9BZX4 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ROPN1BQ9BZX4 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ROPN1BQ9BZX4 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ROPN1BQ9BZX4 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ROPN1BQ9BZX4 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ROPN1BQ9BZX4 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ROPN1BQ9BZX4 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ROPN1BQ9BZX4 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ROPN1BQ9BZX4 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ROPN1BQ9BZX4 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ROPN1BQ9BZX4 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ROPN1BQ9BZX4 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ROPN1BQ9BZX4 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ROPN1BQ9BZX4 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ROPN1BQ9BZX4 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ROPN1BQ9BZX4 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ROPN1BQ9BZX4 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ROPN1BQ9BZX4 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ROPN1BQ9BZX4 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ROPN1BQ9BZX4 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ROPN1BQ9BZX4 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ROPN1BQ9BZX4 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ROPN1BQ9BZX4 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.1 ms