Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE3

BARHL1, BarH-like 1 homeobox protein, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BARHL1Q9BZE3 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BARHL1Q9BZE3 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BARHL1Q9BZE3 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BARHL1Q9BZE3 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BARHL1Q9BZE3 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BARHL1Q9BZE3 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BARHL1Q9BZE3 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BARHL1Q9BZE3 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
BARHL1Q9BZE3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BARHL1Q9BZE3 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BARHL1Q9BZE3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BARHL1Q9BZE3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BARHL1Q9BZE3 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BARHL1Q9BZE3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BARHL1Q9BZE3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BARHL1Q9BZE3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BARHL1Q9BZE3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BARHL1Q9BZE3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BARHL1Q9BZE3 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BARHL1Q9BZE3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BARHL1Q9BZE3 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BARHL1Q9BZE3 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BARHL1Q9BZE3 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BARHL1Q9BZE3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BARHL1Q9BZE3 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BARHL1Q9BZE3 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
BARHL1Q9BZE3 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BARHL1Q9BZE3 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BARHL1Q9BZE3 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BARHL1Q9BZE3 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BARHL1Q9BZE3 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BARHL1Q9BZE3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BARHL1Q9BZE3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BARHL1Q9BZE3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BARHL1Q9BZE3 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BARHL1Q9BZE3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BARHL1Q9BZE3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BARHL1Q9BZE3 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BARHL1Q9BZE3 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BARHL1Q9BZE3 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
BARHL1Q9BZE3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
BARHL1Q9BZE3 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
BARHL1Q9BZE3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
BARHL1Q9BZE3 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
BARHL1Q9BZE3 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
BARHL1Q9BZE3 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
BARHL1Q9BZE3 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
BARHL1Q9BZE3 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
BARHL1Q9BZE3 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
BARHL1Q9BZE3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
BARHL1Q9BZE3 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
BARHL1Q9BZE3 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
BARHL1Q9BZE3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
BARHL1Q9BZE3 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BARHL1Q9BZE3 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BARHL1Q9BZE3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BARHL1Q9BZE3 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BARHL1Q9BZE3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BARHL1Q9BZE3 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BARHL1Q9BZE3 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BARHL1Q9BZE3 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BARHL1Q9BZE3 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BARHL1Q9BZE3 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
BARHL1Q9BZE3 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BARHL1Q9BZE3 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BARHL1Q9BZE3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BARHL1Q9BZE3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BARHL1Q9BZE3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BARHL1Q9BZE3 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BARHL1Q9BZE3 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BARHL1Q9BZE3 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BARHL1Q9BZE3 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BARHL1Q9BZE3 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BARHL1Q9BZE3 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BARHL1Q9BZE3 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BARHL1Q9BZE3 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
BARHL1Q9BZE3 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
BARHL1Q9BZE3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BARHL1Q9BZE3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BARHL1Q9BZE3 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BARHL1Q9BZE3 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BARHL1Q9BZE3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BARHL1Q9BZE3 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BARHL1Q9BZE3 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BARHL1Q9BZE3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BARHL1Q9BZE3 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BARHL1Q9BZE3 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BARHL1Q9BZE3 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BARHL1Q9BZE3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BARHL1Q9BZE3 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BARHL1Q9BZE3 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BARHL1Q9BZE3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BARHL1Q9BZE3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BARHL1Q9BZE3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BARHL1Q9BZE3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BARHL1Q9BZE3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BARHL1Q9BZE3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BARHL1Q9BZE3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BARHL1Q9BZE3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BARHL1Q9BZE3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms