Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYD3

MRPL4, 39S ribosomal protein L4, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL4Q9BYD3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MRPL4Q9BYD3 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MRPL4Q9BYD3 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MRPL4Q9BYD3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MRPL4Q9BYD3 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MRPL4Q9BYD3 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MRPL4Q9BYD3 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MRPL4Q9BYD3 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MRPL4Q9BYD3 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MRPL4Q9BYD3 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MRPL4Q9BYD3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MRPL4Q9BYD3 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MRPL4Q9BYD3 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MRPL4Q9BYD3 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MRPL4Q9BYD3 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MRPL4Q9BYD3 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MRPL4Q9BYD3 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MRPL4Q9BYD3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MRPL4Q9BYD3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
MRPL4Q9BYD3 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MRPL4Q9BYD3 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MRPL4Q9BYD3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MRPL4Q9BYD3 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MRPL4Q9BYD3 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MRPL4Q9BYD3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
MRPL4Q9BYD3 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MRPL4Q9BYD3 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MRPL4Q9BYD3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MRPL4Q9BYD3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MRPL4Q9BYD3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MRPL4Q9BYD3 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MRPL4Q9BYD3 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MRPL4Q9BYD3 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MRPL4Q9BYD3 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MRPL4Q9BYD3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MRPL4Q9BYD3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MRPL4Q9BYD3 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MRPL4Q9BYD3 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MRPL4Q9BYD3 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MRPL4Q9BYD3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MRPL4Q9BYD3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MRPL4Q9BYD3 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MRPL4Q9BYD3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MRPL4Q9BYD3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MRPL4Q9BYD3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MRPL4Q9BYD3 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MRPL4Q9BYD3 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MRPL4Q9BYD3 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MRPL4Q9BYD3 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MRPL4Q9BYD3 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MRPL4Q9BYD3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
MRPL4Q9BYD3 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
MRPL4Q9BYD3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
MRPL4Q9BYD3 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MRPL4Q9BYD3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MRPL4Q9BYD3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MRPL4Q9BYD3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MRPL4Q9BYD3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MRPL4Q9BYD3 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MRPL4Q9BYD3 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
MRPL4Q9BYD3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MRPL4Q9BYD3 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MRPL4Q9BYD3 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MRPL4Q9BYD3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MRPL4Q9BYD3 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MRPL4Q9BYD3 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MRPL4Q9BYD3 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MRPL4Q9BYD3 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MRPL4Q9BYD3 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MRPL4Q9BYD3 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MRPL4Q9BYD3 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MRPL4Q9BYD3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MRPL4Q9BYD3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MRPL4Q9BYD3 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MRPL4Q9BYD3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MRPL4Q9BYD3 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MRPL4Q9BYD3 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MRPL4Q9BYD3 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MRPL4Q9BYD3 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
MRPL4Q9BYD3 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MRPL4Q9BYD3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MRPL4Q9BYD3 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MRPL4Q9BYD3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MRPL4Q9BYD3 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MRPL4Q9BYD3 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MRPL4Q9BYD3 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MRPL4Q9BYD3 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MRPL4Q9BYD3 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
MRPL4Q9BYD3 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
MRPL4Q9BYD3 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MRPL4Q9BYD3 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MRPL4Q9BYD3 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MRPL4Q9BYD3 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MRPL4Q9BYD3 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
MRPL4Q9BYD3 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MRPL4Q9BYD3 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MRPL4Q9BYD3 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MRPL4Q9BYD3 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MRPL4Q9BYD3 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MRPL4Q9BYD3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms