Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY66

KDM5D, Lysine-specific demethylase 5D, humanhuman

Predictions only

Length 1,539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5DQ9BY66 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC34.43■■■■□ 3.1
KDM5DQ9BY66 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.43■■■■□ 3.1
KDM5DQ9BY66 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
KDM5DQ9BY66 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
KDM5DQ9BY66 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
KDM5DQ9BY66 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC34.42■■■■□ 3.1
KDM5DQ9BY66 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
KDM5DQ9BY66 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
KDM5DQ9BY66 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
KDM5DQ9BY66 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC34.41■■■■□ 3.1
KDM5DQ9BY66 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
KDM5DQ9BY66 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
KDM5DQ9BY66 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
KDM5DQ9BY66 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC34.4■■■■□ 3.1
KDM5DQ9BY66 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
KDM5DQ9BY66 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
KDM5DQ9BY66 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
KDM5DQ9BY66 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
KDM5DQ9BY66 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
KDM5DQ9BY66 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
KDM5DQ9BY66 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
KDM5DQ9BY66 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
KDM5DQ9BY66 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
KDM5DQ9BY66 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
KDM5DQ9BY66 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
KDM5DQ9BY66 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
KDM5DQ9BY66 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
KDM5DQ9BY66 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
KDM5DQ9BY66 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
KDM5DQ9BY66 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
KDM5DQ9BY66 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
KDM5DQ9BY66 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
KDM5DQ9BY66 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
KDM5DQ9BY66 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
KDM5DQ9BY66 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
KDM5DQ9BY66 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
KDM5DQ9BY66 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
KDM5DQ9BY66 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
KDM5DQ9BY66 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC34.37■■■■□ 3.09
KDM5DQ9BY66 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
KDM5DQ9BY66 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
KDM5DQ9BY66 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
KDM5DQ9BY66 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
KDM5DQ9BY66 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC34.36■■■■□ 3.09
KDM5DQ9BY66 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
KDM5DQ9BY66 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
KDM5DQ9BY66 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
KDM5DQ9BY66 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
KDM5DQ9BY66 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
KDM5DQ9BY66 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
KDM5DQ9BY66 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
KDM5DQ9BY66 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
KDM5DQ9BY66 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
KDM5DQ9BY66 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
KDM5DQ9BY66 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
KDM5DQ9BY66 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
KDM5DQ9BY66 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
KDM5DQ9BY66 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
KDM5DQ9BY66 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC34.33■■■■□ 3.09
KDM5DQ9BY66 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
KDM5DQ9BY66 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
KDM5DQ9BY66 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
KDM5DQ9BY66 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
KDM5DQ9BY66 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
KDM5DQ9BY66 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
KDM5DQ9BY66 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
KDM5DQ9BY66 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
KDM5DQ9BY66 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
KDM5DQ9BY66 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
KDM5DQ9BY66 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
KDM5DQ9BY66 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
KDM5DQ9BY66 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
KDM5DQ9BY66 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
KDM5DQ9BY66 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
KDM5DQ9BY66 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
KDM5DQ9BY66 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
KDM5DQ9BY66 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
KDM5DQ9BY66 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
KDM5DQ9BY66 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
KDM5DQ9BY66 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
KDM5DQ9BY66 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
KDM5DQ9BY66 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
KDM5DQ9BY66 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
KDM5DQ9BY66 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
KDM5DQ9BY66 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC34.27■■■■□ 3.08
KDM5DQ9BY66 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
KDM5DQ9BY66 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
KDM5DQ9BY66 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
KDM5DQ9BY66 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
KDM5DQ9BY66 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
KDM5DQ9BY66 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
KDM5DQ9BY66 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.08
KDM5DQ9BY66 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
KDM5DQ9BY66 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.08
KDM5DQ9BY66 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC34.26■■■■□ 3.08
KDM5DQ9BY66 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
KDM5DQ9BY66 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC34.26■■■■□ 3.07
KDM5DQ9BY66 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
KDM5DQ9BY66 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
KDM5DQ9BY66 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms