Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms