Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
BRIP1Q9BX63 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
BRIP1Q9BX63 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
BRIP1Q9BX63 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
BRIP1Q9BX63 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
BRIP1Q9BX63 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
BRIP1Q9BX63 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
BRIP1Q9BX63 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
BRIP1Q9BX63 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
BRIP1Q9BX63 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
BRIP1Q9BX63 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
BRIP1Q9BX63 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
BRIP1Q9BX63 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
BRIP1Q9BX63 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
BRIP1Q9BX63 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
BRIP1Q9BX63 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
BRIP1Q9BX63 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
BRIP1Q9BX63 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
BRIP1Q9BX63 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
BRIP1Q9BX63 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
BRIP1Q9BX63 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
BRIP1Q9BX63 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
BRIP1Q9BX63 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.2
BRIP1Q9BX63 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
BRIP1Q9BX63 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
BRIP1Q9BX63 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
BRIP1Q9BX63 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
BRIP1Q9BX63 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
BRIP1Q9BX63 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
BRIP1Q9BX63 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
BRIP1Q9BX63 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
BRIP1Q9BX63 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
BRIP1Q9BX63 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
BRIP1Q9BX63 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
BRIP1Q9BX63 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
BRIP1Q9BX63 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
BRIP1Q9BX63 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
BRIP1Q9BX63 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
BRIP1Q9BX63 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
BRIP1Q9BX63 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
BRIP1Q9BX63 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
BRIP1Q9BX63 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
BRIP1Q9BX63 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
BRIP1Q9BX63 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
BRIP1Q9BX63 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
BRIP1Q9BX63 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
BRIP1Q9BX63 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
BRIP1Q9BX63 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
BRIP1Q9BX63 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
BRIP1Q9BX63 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
BRIP1Q9BX63 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
BRIP1Q9BX63 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
BRIP1Q9BX63 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
BRIP1Q9BX63 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
BRIP1Q9BX63 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
BRIP1Q9BX63 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
BRIP1Q9BX63 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
BRIP1Q9BX63 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
BRIP1Q9BX63 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
BRIP1Q9BX63 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
BRIP1Q9BX63 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
BRIP1Q9BX63 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
BRIP1Q9BX63 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
BRIP1Q9BX63 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
BRIP1Q9BX63 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
BRIP1Q9BX63 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
BRIP1Q9BX63 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
BRIP1Q9BX63 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
BRIP1Q9BX63 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
BRIP1Q9BX63 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
BRIP1Q9BX63 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
BRIP1Q9BX63 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
BRIP1Q9BX63 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
BRIP1Q9BX63 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
BRIP1Q9BX63 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
BRIP1Q9BX63 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
BRIP1Q9BX63 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
BRIP1Q9BX63 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
BRIP1Q9BX63 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
BRIP1Q9BX63 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
BRIP1Q9BX63 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
BRIP1Q9BX63 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
BRIP1Q9BX63 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
BRIP1Q9BX63 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
BRIP1Q9BX63 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
BRIP1Q9BX63 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
BRIP1Q9BX63 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
BRIP1Q9BX63 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
BRIP1Q9BX63 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
BRIP1Q9BX63 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
BRIP1Q9BX63 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
BRIP1Q9BX63 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
BRIP1Q9BX63 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
BRIP1Q9BX63 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
BRIP1Q9BX63 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
BRIP1Q9BX63 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
BRIP1Q9BX63 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
BRIP1Q9BX63 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
BRIP1Q9BX63 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
BRIP1Q9BX63 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms