Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWX1

PHF7, PHD finger protein 7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF7Q9BWX1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PHF7Q9BWX1 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
PHF7Q9BWX1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PHF7Q9BWX1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PHF7Q9BWX1 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PHF7Q9BWX1 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PHF7Q9BWX1 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PHF7Q9BWX1 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PHF7Q9BWX1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PHF7Q9BWX1 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PHF7Q9BWX1 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PHF7Q9BWX1 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PHF7Q9BWX1 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PHF7Q9BWX1 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PHF7Q9BWX1 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PHF7Q9BWX1 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PHF7Q9BWX1 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PHF7Q9BWX1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PHF7Q9BWX1 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PHF7Q9BWX1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PHF7Q9BWX1 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PHF7Q9BWX1 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PHF7Q9BWX1 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PHF7Q9BWX1 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PHF7Q9BWX1 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PHF7Q9BWX1 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PHF7Q9BWX1 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PHF7Q9BWX1 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PHF7Q9BWX1 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PHF7Q9BWX1 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PHF7Q9BWX1 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PHF7Q9BWX1 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PHF7Q9BWX1 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PHF7Q9BWX1 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PHF7Q9BWX1 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PHF7Q9BWX1 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PHF7Q9BWX1 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PHF7Q9BWX1 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PHF7Q9BWX1 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PHF7Q9BWX1 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PHF7Q9BWX1 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PHF7Q9BWX1 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PHF7Q9BWX1 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PHF7Q9BWX1 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PHF7Q9BWX1 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PHF7Q9BWX1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PHF7Q9BWX1 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PHF7Q9BWX1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PHF7Q9BWX1 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PHF7Q9BWX1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PHF7Q9BWX1 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PHF7Q9BWX1 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PHF7Q9BWX1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PHF7Q9BWX1 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PHF7Q9BWX1 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PHF7Q9BWX1 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PHF7Q9BWX1 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PHF7Q9BWX1 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PHF7Q9BWX1 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PHF7Q9BWX1 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PHF7Q9BWX1 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PHF7Q9BWX1 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PHF7Q9BWX1 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PHF7Q9BWX1 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PHF7Q9BWX1 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PHF7Q9BWX1 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PHF7Q9BWX1 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PHF7Q9BWX1 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PHF7Q9BWX1 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PHF7Q9BWX1 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PHF7Q9BWX1 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PHF7Q9BWX1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PHF7Q9BWX1 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PHF7Q9BWX1 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PHF7Q9BWX1 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PHF7Q9BWX1 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PHF7Q9BWX1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PHF7Q9BWX1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PHF7Q9BWX1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PHF7Q9BWX1 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PHF7Q9BWX1 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PHF7Q9BWX1 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PHF7Q9BWX1 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PHF7Q9BWX1 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PHF7Q9BWX1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PHF7Q9BWX1 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PHF7Q9BWX1 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PHF7Q9BWX1 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PHF7Q9BWX1 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PHF7Q9BWX1 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PHF7Q9BWX1 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PHF7Q9BWX1 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PHF7Q9BWX1 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PHF7Q9BWX1 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PHF7Q9BWX1 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PHF7Q9BWX1 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PHF7Q9BWX1 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PHF7Q9BWX1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PHF7Q9BWX1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PHF7Q9BWX1 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms