Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVW6

SMIM2, Small integral membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM2Q9BVW6 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMIM2Q9BVW6 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMIM2Q9BVW6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMIM2Q9BVW6 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMIM2Q9BVW6 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMIM2Q9BVW6 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMIM2Q9BVW6 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMIM2Q9BVW6 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMIM2Q9BVW6 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMIM2Q9BVW6 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMIM2Q9BVW6 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMIM2Q9BVW6 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMIM2Q9BVW6 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMIM2Q9BVW6 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
SMIM2Q9BVW6 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
SMIM2Q9BVW6 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SMIM2Q9BVW6 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SMIM2Q9BVW6 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SMIM2Q9BVW6 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM2Q9BVW6 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM2Q9BVW6 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM2Q9BVW6 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM2Q9BVW6 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM2Q9BVW6 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM2Q9BVW6 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM2Q9BVW6 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM2Q9BVW6 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM2Q9BVW6 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM2Q9BVW6 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM2Q9BVW6 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM2Q9BVW6 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM2Q9BVW6 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM2Q9BVW6 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM2Q9BVW6 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM2Q9BVW6 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMIM2Q9BVW6 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SMIM2Q9BVW6 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMIM2Q9BVW6 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMIM2Q9BVW6 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMIM2Q9BVW6 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMIM2Q9BVW6 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMIM2Q9BVW6 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMIM2Q9BVW6 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMIM2Q9BVW6 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMIM2Q9BVW6 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SMIM2Q9BVW6 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SMIM2Q9BVW6 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SMIM2Q9BVW6 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMIM2Q9BVW6 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SMIM2Q9BVW6 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMIM2Q9BVW6 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMIM2Q9BVW6 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMIM2Q9BVW6 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SMIM2Q9BVW6 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMIM2Q9BVW6 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMIM2Q9BVW6 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMIM2Q9BVW6 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMIM2Q9BVW6 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMIM2Q9BVW6 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMIM2Q9BVW6 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMIM2Q9BVW6 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMIM2Q9BVW6 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMIM2Q9BVW6 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMIM2Q9BVW6 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMIM2Q9BVW6 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMIM2Q9BVW6 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMIM2Q9BVW6 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMIM2Q9BVW6 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMIM2Q9BVW6 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMIM2Q9BVW6 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMIM2Q9BVW6 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMIM2Q9BVW6 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMIM2Q9BVW6 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMIM2Q9BVW6 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMIM2Q9BVW6 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMIM2Q9BVW6 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMIM2Q9BVW6 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMIM2Q9BVW6 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMIM2Q9BVW6 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMIM2Q9BVW6 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMIM2Q9BVW6 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMIM2Q9BVW6 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMIM2Q9BVW6 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMIM2Q9BVW6 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMIM2Q9BVW6 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMIM2Q9BVW6 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMIM2Q9BVW6 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMIM2Q9BVW6 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMIM2Q9BVW6 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMIM2Q9BVW6 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMIM2Q9BVW6 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SMIM2Q9BVW6 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMIM2Q9BVW6 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMIM2Q9BVW6 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SMIM2Q9BVW6 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMIM2Q9BVW6 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMIM2Q9BVW6 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMIM2Q9BVW6 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMIM2Q9BVW6 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMIM2Q9BVW6 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.7 ms