Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA1

TUBB2B, Tubulin beta-2B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB2BQ9BVA1 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TUBB2BQ9BVA1 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TUBB2BQ9BVA1 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TUBB2BQ9BVA1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TUBB2BQ9BVA1 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TUBB2BQ9BVA1 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TUBB2BQ9BVA1 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TUBB2BQ9BVA1 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TUBB2BQ9BVA1 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TUBB2BQ9BVA1 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TUBB2BQ9BVA1 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TUBB2BQ9BVA1 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TUBB2BQ9BVA1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TUBB2BQ9BVA1 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TUBB2BQ9BVA1 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TUBB2BQ9BVA1 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TUBB2BQ9BVA1 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TUBB2BQ9BVA1 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TUBB2BQ9BVA1 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TUBB2BQ9BVA1 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TUBB2BQ9BVA1 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TUBB2BQ9BVA1 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TUBB2BQ9BVA1 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TUBB2BQ9BVA1 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TUBB2BQ9BVA1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TUBB2BQ9BVA1 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TUBB2BQ9BVA1 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TUBB2BQ9BVA1 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TUBB2BQ9BVA1 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TUBB2BQ9BVA1 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TUBB2BQ9BVA1 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TUBB2BQ9BVA1 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TUBB2BQ9BVA1 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TUBB2BQ9BVA1 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TUBB2BQ9BVA1 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TUBB2BQ9BVA1 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TUBB2BQ9BVA1 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TUBB2BQ9BVA1 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TUBB2BQ9BVA1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TUBB2BQ9BVA1 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TUBB2BQ9BVA1 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TUBB2BQ9BVA1 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TUBB2BQ9BVA1 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TUBB2BQ9BVA1 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TUBB2BQ9BVA1 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TUBB2BQ9BVA1 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TUBB2BQ9BVA1 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TUBB2BQ9BVA1 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TUBB2BQ9BVA1 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TUBB2BQ9BVA1 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TUBB2BQ9BVA1 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TUBB2BQ9BVA1 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TUBB2BQ9BVA1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TUBB2BQ9BVA1 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TUBB2BQ9BVA1 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TUBB2BQ9BVA1 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TUBB2BQ9BVA1 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TUBB2BQ9BVA1 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TUBB2BQ9BVA1 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TUBB2BQ9BVA1 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TUBB2BQ9BVA1 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TUBB2BQ9BVA1 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TUBB2BQ9BVA1 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TUBB2BQ9BVA1 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TUBB2BQ9BVA1 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TUBB2BQ9BVA1 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TUBB2BQ9BVA1 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TUBB2BQ9BVA1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TUBB2BQ9BVA1 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TUBB2BQ9BVA1 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TUBB2BQ9BVA1 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TUBB2BQ9BVA1 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TUBB2BQ9BVA1 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TUBB2BQ9BVA1 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TUBB2BQ9BVA1 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TUBB2BQ9BVA1 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TUBB2BQ9BVA1 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TUBB2BQ9BVA1 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TUBB2BQ9BVA1 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TUBB2BQ9BVA1 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TUBB2BQ9BVA1 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TUBB2BQ9BVA1 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TUBB2BQ9BVA1 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TUBB2BQ9BVA1 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TUBB2BQ9BVA1 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TUBB2BQ9BVA1 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TUBB2BQ9BVA1 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TUBB2BQ9BVA1 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TUBB2BQ9BVA1 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TUBB2BQ9BVA1 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TUBB2BQ9BVA1 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TUBB2BQ9BVA1 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TUBB2BQ9BVA1 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TUBB2BQ9BVA1 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TUBB2BQ9BVA1 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TUBB2BQ9BVA1 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TUBB2BQ9BVA1 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TUBB2BQ9BVA1 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TUBB2BQ9BVA1 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TUBB2BQ9BVA1 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms