Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV19

C1orf50, Uncharacterized protein C1orf50, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf50Q9BV19 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C1orf50Q9BV19 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C1orf50Q9BV19 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C1orf50Q9BV19 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C1orf50Q9BV19 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C1orf50Q9BV19 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C1orf50Q9BV19 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C1orf50Q9BV19 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
C1orf50Q9BV19 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C1orf50Q9BV19 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1orf50Q9BV19 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1orf50Q9BV19 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1orf50Q9BV19 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1orf50Q9BV19 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1orf50Q9BV19 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1orf50Q9BV19 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1orf50Q9BV19 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1orf50Q9BV19 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1orf50Q9BV19 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1orf50Q9BV19 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
C1orf50Q9BV19 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C1orf50Q9BV19 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C1orf50Q9BV19 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
C1orf50Q9BV19 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C1orf50Q9BV19 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C1orf50Q9BV19 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C1orf50Q9BV19 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C1orf50Q9BV19 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C1orf50Q9BV19 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C1orf50Q9BV19 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C1orf50Q9BV19 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C1orf50Q9BV19 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C1orf50Q9BV19 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C1orf50Q9BV19 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C1orf50Q9BV19 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C1orf50Q9BV19 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
C1orf50Q9BV19 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C1orf50Q9BV19 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1orf50Q9BV19 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1orf50Q9BV19 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1orf50Q9BV19 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1orf50Q9BV19 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1orf50Q9BV19 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1orf50Q9BV19 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
C1orf50Q9BV19 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1orf50Q9BV19 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1orf50Q9BV19 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1orf50Q9BV19 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1orf50Q9BV19 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1orf50Q9BV19 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1orf50Q9BV19 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1orf50Q9BV19 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1orf50Q9BV19 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1orf50Q9BV19 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C1orf50Q9BV19 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C1orf50Q9BV19 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C1orf50Q9BV19 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C1orf50Q9BV19 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C1orf50Q9BV19 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C1orf50Q9BV19 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C1orf50Q9BV19 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C1orf50Q9BV19 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C1orf50Q9BV19 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C1orf50Q9BV19 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C1orf50Q9BV19 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C1orf50Q9BV19 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C1orf50Q9BV19 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C1orf50Q9BV19 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C1orf50Q9BV19 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C1orf50Q9BV19 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C1orf50Q9BV19 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C1orf50Q9BV19 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C1orf50Q9BV19 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C1orf50Q9BV19 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C1orf50Q9BV19 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C1orf50Q9BV19 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C1orf50Q9BV19 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C1orf50Q9BV19 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
C1orf50Q9BV19 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C1orf50Q9BV19 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C1orf50Q9BV19 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C1orf50Q9BV19 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C1orf50Q9BV19 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C1orf50Q9BV19 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C1orf50Q9BV19 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
C1orf50Q9BV19 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C1orf50Q9BV19 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C1orf50Q9BV19 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
C1orf50Q9BV19 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C1orf50Q9BV19 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C1orf50Q9BV19 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C1orf50Q9BV19 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C1orf50Q9BV19 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C1orf50Q9BV19 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C1orf50Q9BV19 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C1orf50Q9BV19 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C1orf50Q9BV19 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C1orf50Q9BV19 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
C1orf50Q9BV19 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C1orf50Q9BV19 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms