Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTU6

PI4K2A, Phosphatidylinositol 4-kinase type 2-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PI4K2AQ9BTU6 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PI4K2AQ9BTU6 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PI4K2AQ9BTU6 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PI4K2AQ9BTU6 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PI4K2AQ9BTU6 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PI4K2AQ9BTU6 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PI4K2AQ9BTU6 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PI4K2AQ9BTU6 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PI4K2AQ9BTU6 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PI4K2AQ9BTU6 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PI4K2AQ9BTU6 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PI4K2AQ9BTU6 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PI4K2AQ9BTU6 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PI4K2AQ9BTU6 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PI4K2AQ9BTU6 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PI4K2AQ9BTU6 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PI4K2AQ9BTU6 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PI4K2AQ9BTU6 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PI4K2AQ9BTU6 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PI4K2AQ9BTU6 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PI4K2AQ9BTU6 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PI4K2AQ9BTU6 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PI4K2AQ9BTU6 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PI4K2AQ9BTU6 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PI4K2AQ9BTU6 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PI4K2AQ9BTU6 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PI4K2AQ9BTU6 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PI4K2AQ9BTU6 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PI4K2AQ9BTU6 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PI4K2AQ9BTU6 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PI4K2AQ9BTU6 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PI4K2AQ9BTU6 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PI4K2AQ9BTU6 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PI4K2AQ9BTU6 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PI4K2AQ9BTU6 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PI4K2AQ9BTU6 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PI4K2AQ9BTU6 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PI4K2AQ9BTU6 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PI4K2AQ9BTU6 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PI4K2AQ9BTU6 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PI4K2AQ9BTU6 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PI4K2AQ9BTU6 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PI4K2AQ9BTU6 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PI4K2AQ9BTU6 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PI4K2AQ9BTU6 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PI4K2AQ9BTU6 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PI4K2AQ9BTU6 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PI4K2AQ9BTU6 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PI4K2AQ9BTU6 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PI4K2AQ9BTU6 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PI4K2AQ9BTU6 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PI4K2AQ9BTU6 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PI4K2AQ9BTU6 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PI4K2AQ9BTU6 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PI4K2AQ9BTU6 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PI4K2AQ9BTU6 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PI4K2AQ9BTU6 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PI4K2AQ9BTU6 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PI4K2AQ9BTU6 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PI4K2AQ9BTU6 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PI4K2AQ9BTU6 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PI4K2AQ9BTU6 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PI4K2AQ9BTU6 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PI4K2AQ9BTU6 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PI4K2AQ9BTU6 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PI4K2AQ9BTU6 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PI4K2AQ9BTU6 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PI4K2AQ9BTU6 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PI4K2AQ9BTU6 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PI4K2AQ9BTU6 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PI4K2AQ9BTU6 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PI4K2AQ9BTU6 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PI4K2AQ9BTU6 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PI4K2AQ9BTU6 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PI4K2AQ9BTU6 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PI4K2AQ9BTU6 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PI4K2AQ9BTU6 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PI4K2AQ9BTU6 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PI4K2AQ9BTU6 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PI4K2AQ9BTU6 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PI4K2AQ9BTU6 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PI4K2AQ9BTU6 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PI4K2AQ9BTU6 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PI4K2AQ9BTU6 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PI4K2AQ9BTU6 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PI4K2AQ9BTU6 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PI4K2AQ9BTU6 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PI4K2AQ9BTU6 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PI4K2AQ9BTU6 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PI4K2AQ9BTU6 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PI4K2AQ9BTU6 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PI4K2AQ9BTU6 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PI4K2AQ9BTU6 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PI4K2AQ9BTU6 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PI4K2AQ9BTU6 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PI4K2AQ9BTU6 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PI4K2AQ9BTU6 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PI4K2AQ9BTU6 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PI4K2AQ9BTU6 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PI4K2AQ9BTU6 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms