Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RTKNQ9BST9 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RTKNQ9BST9 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RTKNQ9BST9 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RTKNQ9BST9 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RTKNQ9BST9 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RTKNQ9BST9 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RTKNQ9BST9 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RTKNQ9BST9 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RTKNQ9BST9 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RTKNQ9BST9 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RTKNQ9BST9 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RTKNQ9BST9 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RTKNQ9BST9 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RTKNQ9BST9 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RTKNQ9BST9 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RTKNQ9BST9 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RTKNQ9BST9 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RTKNQ9BST9 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RTKNQ9BST9 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RTKNQ9BST9 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RTKNQ9BST9 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RTKNQ9BST9 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RTKNQ9BST9 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RTKNQ9BST9 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RTKNQ9BST9 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RTKNQ9BST9 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RTKNQ9BST9 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RTKNQ9BST9 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RTKNQ9BST9 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RTKNQ9BST9 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RTKNQ9BST9 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RTKNQ9BST9 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RTKNQ9BST9 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RTKNQ9BST9 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RTKNQ9BST9 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RTKNQ9BST9 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RTKNQ9BST9 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RTKNQ9BST9 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RTKNQ9BST9 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RTKNQ9BST9 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RTKNQ9BST9 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RTKNQ9BST9 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RTKNQ9BST9 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RTKNQ9BST9 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RTKNQ9BST9 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RTKNQ9BST9 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RTKNQ9BST9 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RTKNQ9BST9 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RTKNQ9BST9 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RTKNQ9BST9 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RTKNQ9BST9 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RTKNQ9BST9 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RTKNQ9BST9 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RTKNQ9BST9 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RTKNQ9BST9 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RTKNQ9BST9 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RTKNQ9BST9 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RTKNQ9BST9 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RTKNQ9BST9 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RTKNQ9BST9 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RTKNQ9BST9 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RTKNQ9BST9 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RTKNQ9BST9 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RTKNQ9BST9 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RTKNQ9BST9 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RTKNQ9BST9 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RTKNQ9BST9 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RTKNQ9BST9 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RTKNQ9BST9 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RTKNQ9BST9 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RTKNQ9BST9 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RTKNQ9BST9 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RTKNQ9BST9 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RTKNQ9BST9 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RTKNQ9BST9 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RTKNQ9BST9 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RTKNQ9BST9 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RTKNQ9BST9 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RTKNQ9BST9 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RTKNQ9BST9 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RTKNQ9BST9 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
RTKNQ9BST9 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
RTKNQ9BST9 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RTKNQ9BST9 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RTKNQ9BST9 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RTKNQ9BST9 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RTKNQ9BST9 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RTKNQ9BST9 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RTKNQ9BST9 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RTKNQ9BST9 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RTKNQ9BST9 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RTKNQ9BST9 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RTKNQ9BST9 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RTKNQ9BST9 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
RTKNQ9BST9 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RTKNQ9BST9 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RTKNQ9BST9 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RTKNQ9BST9 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RTKNQ9BST9 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.5 ms