Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSQ5

CCM2, Cerebral cavernous malformations 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCM2Q9BSQ5 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCM2Q9BSQ5 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCM2Q9BSQ5 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CCM2Q9BSQ5 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCM2Q9BSQ5 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCM2Q9BSQ5 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCM2Q9BSQ5 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCM2Q9BSQ5 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCM2Q9BSQ5 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CCM2Q9BSQ5 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCM2Q9BSQ5 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCM2Q9BSQ5 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCM2Q9BSQ5 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCM2Q9BSQ5 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCM2Q9BSQ5 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCM2Q9BSQ5 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCM2Q9BSQ5 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCM2Q9BSQ5 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCM2Q9BSQ5 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCM2Q9BSQ5 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCM2Q9BSQ5 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCM2Q9BSQ5 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCM2Q9BSQ5 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCM2Q9BSQ5 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCM2Q9BSQ5 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCM2Q9BSQ5 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCM2Q9BSQ5 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCM2Q9BSQ5 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCM2Q9BSQ5 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCM2Q9BSQ5 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCM2Q9BSQ5 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCM2Q9BSQ5 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCM2Q9BSQ5 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCM2Q9BSQ5 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCM2Q9BSQ5 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCM2Q9BSQ5 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CCM2Q9BSQ5 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCM2Q9BSQ5 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCM2Q9BSQ5 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCM2Q9BSQ5 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCM2Q9BSQ5 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCM2Q9BSQ5 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCM2Q9BSQ5 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCM2Q9BSQ5 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCM2Q9BSQ5 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCM2Q9BSQ5 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCM2Q9BSQ5 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCM2Q9BSQ5 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCM2Q9BSQ5 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCM2Q9BSQ5 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCM2Q9BSQ5 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCM2Q9BSQ5 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCM2Q9BSQ5 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCM2Q9BSQ5 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCM2Q9BSQ5 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCM2Q9BSQ5 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCM2Q9BSQ5 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCM2Q9BSQ5 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCM2Q9BSQ5 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCM2Q9BSQ5 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCM2Q9BSQ5 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCM2Q9BSQ5 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCM2Q9BSQ5 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCM2Q9BSQ5 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCM2Q9BSQ5 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCM2Q9BSQ5 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCM2Q9BSQ5 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCM2Q9BSQ5 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCM2Q9BSQ5 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCM2Q9BSQ5 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCM2Q9BSQ5 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCM2Q9BSQ5 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCM2Q9BSQ5 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCM2Q9BSQ5 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCM2Q9BSQ5 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCM2Q9BSQ5 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCM2Q9BSQ5 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCM2Q9BSQ5 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCM2Q9BSQ5 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCM2Q9BSQ5 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCM2Q9BSQ5 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCM2Q9BSQ5 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CCM2Q9BSQ5 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCM2Q9BSQ5 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCM2Q9BSQ5 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCM2Q9BSQ5 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CCM2Q9BSQ5 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CCM2Q9BSQ5 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCM2Q9BSQ5 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCM2Q9BSQ5 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCM2Q9BSQ5 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCM2Q9BSQ5 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCM2Q9BSQ5 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCM2Q9BSQ5 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCM2Q9BSQ5 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCM2Q9BSQ5 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCM2Q9BSQ5 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCM2Q9BSQ5 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCM2Q9BSQ5 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCM2Q9BSQ5 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms