Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSA9

TMEM175, Endosomal/lysosomal potassium channel TMEM175, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM175Q9BSA9 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM175Q9BSA9 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM175Q9BSA9 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM175Q9BSA9 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM175Q9BSA9 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM175Q9BSA9 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM175Q9BSA9 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM175Q9BSA9 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM175Q9BSA9 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM175Q9BSA9 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM175Q9BSA9 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM175Q9BSA9 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM175Q9BSA9 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM175Q9BSA9 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM175Q9BSA9 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM175Q9BSA9 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM175Q9BSA9 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM175Q9BSA9 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM175Q9BSA9 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM175Q9BSA9 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM175Q9BSA9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM175Q9BSA9 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM175Q9BSA9 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM175Q9BSA9 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM175Q9BSA9 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM175Q9BSA9 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM175Q9BSA9 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMEM175Q9BSA9 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMEM175Q9BSA9 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMEM175Q9BSA9 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMEM175Q9BSA9 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TMEM175Q9BSA9 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TMEM175Q9BSA9 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM175Q9BSA9 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM175Q9BSA9 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM175Q9BSA9 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM175Q9BSA9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM175Q9BSA9 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM175Q9BSA9 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM175Q9BSA9 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM175Q9BSA9 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM175Q9BSA9 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM175Q9BSA9 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM175Q9BSA9 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM175Q9BSA9 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM175Q9BSA9 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM175Q9BSA9 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM175Q9BSA9 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM175Q9BSA9 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMEM175Q9BSA9 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMEM175Q9BSA9 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TMEM175Q9BSA9 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMEM175Q9BSA9 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM175Q9BSA9 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM175Q9BSA9 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM175Q9BSA9 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM175Q9BSA9 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM175Q9BSA9 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM175Q9BSA9 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM175Q9BSA9 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM175Q9BSA9 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM175Q9BSA9 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM175Q9BSA9 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM175Q9BSA9 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TMEM175Q9BSA9 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
TMEM175Q9BSA9 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
TMEM175Q9BSA9 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TMEM175Q9BSA9 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TMEM175Q9BSA9 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TMEM175Q9BSA9 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM175Q9BSA9 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM175Q9BSA9 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM175Q9BSA9 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM175Q9BSA9 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM175Q9BSA9 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM175Q9BSA9 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM175Q9BSA9 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM175Q9BSA9 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM175Q9BSA9 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM175Q9BSA9 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM175Q9BSA9 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM175Q9BSA9 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM175Q9BSA9 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM175Q9BSA9 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM175Q9BSA9 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM175Q9BSA9 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM175Q9BSA9 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM175Q9BSA9 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM175Q9BSA9 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM175Q9BSA9 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM175Q9BSA9 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM175Q9BSA9 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM175Q9BSA9 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM175Q9BSA9 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM175Q9BSA9 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM175Q9BSA9 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM175Q9BSA9 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM175Q9BSA9 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM175Q9BSA9 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM175Q9BSA9 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms