Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQD1

PMCHL2, Putative pro-MCH-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL2Q9BQD1 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PMCHL2Q9BQD1 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PMCHL2Q9BQD1 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PMCHL2Q9BQD1 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PMCHL2Q9BQD1 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PMCHL2Q9BQD1 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PMCHL2Q9BQD1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PMCHL2Q9BQD1 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PMCHL2Q9BQD1 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PMCHL2Q9BQD1 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PMCHL2Q9BQD1 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PMCHL2Q9BQD1 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PMCHL2Q9BQD1 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PMCHL2Q9BQD1 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PMCHL2Q9BQD1 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PMCHL2Q9BQD1 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PMCHL2Q9BQD1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PMCHL2Q9BQD1 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PMCHL2Q9BQD1 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PMCHL2Q9BQD1 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PMCHL2Q9BQD1 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PMCHL2Q9BQD1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PMCHL2Q9BQD1 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PMCHL2Q9BQD1 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PMCHL2Q9BQD1 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PMCHL2Q9BQD1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PMCHL2Q9BQD1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PMCHL2Q9BQD1 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PMCHL2Q9BQD1 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PMCHL2Q9BQD1 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PMCHL2Q9BQD1 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PMCHL2Q9BQD1 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PMCHL2Q9BQD1 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PMCHL2Q9BQD1 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PMCHL2Q9BQD1 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PMCHL2Q9BQD1 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PMCHL2Q9BQD1 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PMCHL2Q9BQD1 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PMCHL2Q9BQD1 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PMCHL2Q9BQD1 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PMCHL2Q9BQD1 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PMCHL2Q9BQD1 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PMCHL2Q9BQD1 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PMCHL2Q9BQD1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PMCHL2Q9BQD1 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PMCHL2Q9BQD1 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PMCHL2Q9BQD1 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PMCHL2Q9BQD1 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PMCHL2Q9BQD1 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PMCHL2Q9BQD1 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PMCHL2Q9BQD1 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PMCHL2Q9BQD1 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PMCHL2Q9BQD1 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PMCHL2Q9BQD1 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PMCHL2Q9BQD1 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PMCHL2Q9BQD1 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PMCHL2Q9BQD1 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PMCHL2Q9BQD1 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PMCHL2Q9BQD1 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PMCHL2Q9BQD1 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PMCHL2Q9BQD1 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PMCHL2Q9BQD1 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PMCHL2Q9BQD1 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PMCHL2Q9BQD1 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PMCHL2Q9BQD1 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PMCHL2Q9BQD1 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PMCHL2Q9BQD1 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PMCHL2Q9BQD1 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PMCHL2Q9BQD1 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PMCHL2Q9BQD1 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PMCHL2Q9BQD1 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PMCHL2Q9BQD1 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PMCHL2Q9BQD1 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PMCHL2Q9BQD1 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PMCHL2Q9BQD1 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PMCHL2Q9BQD1 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PMCHL2Q9BQD1 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PMCHL2Q9BQD1 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PMCHL2Q9BQD1 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PMCHL2Q9BQD1 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PMCHL2Q9BQD1 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PMCHL2Q9BQD1 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PMCHL2Q9BQD1 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PMCHL2Q9BQD1 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PMCHL2Q9BQD1 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PMCHL2Q9BQD1 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PMCHL2Q9BQD1 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PMCHL2Q9BQD1 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PMCHL2Q9BQD1 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PMCHL2Q9BQD1 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PMCHL2Q9BQD1 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PMCHL2Q9BQD1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PMCHL2Q9BQD1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PMCHL2Q9BQD1 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PMCHL2Q9BQD1 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PMCHL2Q9BQD1 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PMCHL2Q9BQD1 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PMCHL2Q9BQD1 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PMCHL2Q9BQD1 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PMCHL2Q9BQD1 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms