Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ61

C19orf43, Uncharacterized protein C19orf43, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C19orf43Q9BQ61 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C19orf43Q9BQ61 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C19orf43Q9BQ61 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
C19orf43Q9BQ61 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C19orf43Q9BQ61 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C19orf43Q9BQ61 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C19orf43Q9BQ61 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C19orf43Q9BQ61 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C19orf43Q9BQ61 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C19orf43Q9BQ61 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C19orf43Q9BQ61 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C19orf43Q9BQ61 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
C19orf43Q9BQ61 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C19orf43Q9BQ61 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C19orf43Q9BQ61 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C19orf43Q9BQ61 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C19orf43Q9BQ61 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
C19orf43Q9BQ61 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C19orf43Q9BQ61 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
C19orf43Q9BQ61 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
C19orf43Q9BQ61 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
C19orf43Q9BQ61 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C19orf43Q9BQ61 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
C19orf43Q9BQ61 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
C19orf43Q9BQ61 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C19orf43Q9BQ61 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C19orf43Q9BQ61 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C19orf43Q9BQ61 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C19orf43Q9BQ61 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C19orf43Q9BQ61 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C19orf43Q9BQ61 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C19orf43Q9BQ61 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C19orf43Q9BQ61 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C19orf43Q9BQ61 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C19orf43Q9BQ61 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C19orf43Q9BQ61 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C19orf43Q9BQ61 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C19orf43Q9BQ61 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C19orf43Q9BQ61 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C19orf43Q9BQ61 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C19orf43Q9BQ61 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C19orf43Q9BQ61 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C19orf43Q9BQ61 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C19orf43Q9BQ61 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C19orf43Q9BQ61 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C19orf43Q9BQ61 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C19orf43Q9BQ61 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C19orf43Q9BQ61 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C19orf43Q9BQ61 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C19orf43Q9BQ61 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C19orf43Q9BQ61 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C19orf43Q9BQ61 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C19orf43Q9BQ61 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C19orf43Q9BQ61 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C19orf43Q9BQ61 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C19orf43Q9BQ61 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C19orf43Q9BQ61 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C19orf43Q9BQ61 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C19orf43Q9BQ61 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C19orf43Q9BQ61 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C19orf43Q9BQ61 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C19orf43Q9BQ61 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C19orf43Q9BQ61 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C19orf43Q9BQ61 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C19orf43Q9BQ61 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C19orf43Q9BQ61 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C19orf43Q9BQ61 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C19orf43Q9BQ61 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C19orf43Q9BQ61 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C19orf43Q9BQ61 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
C19orf43Q9BQ61 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C19orf43Q9BQ61 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C19orf43Q9BQ61 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C19orf43Q9BQ61 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C19orf43Q9BQ61 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C19orf43Q9BQ61 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C19orf43Q9BQ61 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C19orf43Q9BQ61 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C19orf43Q9BQ61 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C19orf43Q9BQ61 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C19orf43Q9BQ61 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
C19orf43Q9BQ61 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C19orf43Q9BQ61 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C19orf43Q9BQ61 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C19orf43Q9BQ61 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C19orf43Q9BQ61 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C19orf43Q9BQ61 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C19orf43Q9BQ61 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C19orf43Q9BQ61 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C19orf43Q9BQ61 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C19orf43Q9BQ61 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
C19orf43Q9BQ61 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C19orf43Q9BQ61 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C19orf43Q9BQ61 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C19orf43Q9BQ61 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C19orf43Q9BQ61 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
C19orf43Q9BQ61 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C19orf43Q9BQ61 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C19orf43Q9BQ61 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C19orf43Q9BQ61 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms