Protein–RNA interactions for Protein: Q99946

PRRT1, Proline-rich transmembrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT1Q99946 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PRRT1Q99946 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PRRT1Q99946 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PRRT1Q99946 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PRRT1Q99946 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PRRT1Q99946 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PRRT1Q99946 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
PRRT1Q99946 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
PRRT1Q99946 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PRRT1Q99946 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PRRT1Q99946 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PRRT1Q99946 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PRRT1Q99946 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PRRT1Q99946 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PRRT1Q99946 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PRRT1Q99946 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
PRRT1Q99946 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
PRRT1Q99946 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
PRRT1Q99946 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
PRRT1Q99946 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PRRT1Q99946 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PRRT1Q99946 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PRRT1Q99946 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PRRT1Q99946 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PRRT1Q99946 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PRRT1Q99946 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PRRT1Q99946 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PRRT1Q99946 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PRRT1Q99946 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PRRT1Q99946 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PRRT1Q99946 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PRRT1Q99946 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PRRT1Q99946 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PRRT1Q99946 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PRRT1Q99946 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PRRT1Q99946 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PRRT1Q99946 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PRRT1Q99946 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PRRT1Q99946 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PRRT1Q99946 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PRRT1Q99946 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
PRRT1Q99946 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PRRT1Q99946 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PRRT1Q99946 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PRRT1Q99946 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PRRT1Q99946 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PRRT1Q99946 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
PRRT1Q99946 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PRRT1Q99946 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PRRT1Q99946 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PRRT1Q99946 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PRRT1Q99946 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PRRT1Q99946 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PRRT1Q99946 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PRRT1Q99946 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PRRT1Q99946 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PRRT1Q99946 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
PRRT1Q99946 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PRRT1Q99946 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
PRRT1Q99946 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRRT1Q99946 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRRT1Q99946 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRRT1Q99946 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRRT1Q99946 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRRT1Q99946 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRRT1Q99946 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRRT1Q99946 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRRT1Q99946 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRRT1Q99946 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRRT1Q99946 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRRT1Q99946 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRRT1Q99946 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRRT1Q99946 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRRT1Q99946 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRRT1Q99946 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRRT1Q99946 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRRT1Q99946 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRRT1Q99946 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRRT1Q99946 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRRT1Q99946 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRRT1Q99946 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRRT1Q99946 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRRT1Q99946 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRRT1Q99946 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRRT1Q99946 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRRT1Q99946 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PRRT1Q99946 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRRT1Q99946 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRRT1Q99946 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRRT1Q99946 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRRT1Q99946 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRRT1Q99946 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRRT1Q99946 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRRT1Q99946 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRRT1Q99946 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRRT1Q99946 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRRT1Q99946 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRRT1Q99946 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRRT1Q99946 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PRRT1Q99946 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms